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Warning message: package(s) not installed when version(s) same as current; use `force = TRUE` to re-install: 'Biobase'

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老师您好 转录因子结合位点怎么预测

  • 2022-03-15 17:39
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老师您好！我要进行小麦基因蛋白互作网络分析，使用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对时是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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老师您好，我要进行基因蛋白互作网络分析，用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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GEO2R三组之间怎么比较呢?

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哭(´;︵;`)，虚拟机下Linux全屏，不知道怎么回去了，情趣帮忙

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课程“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”中，CoNet构建网络时的问题

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关于AI打开PDF地图后部分缺失的问题，我也是R做图后导出PDF，PDF是正常的，但是AI打开就不正常，请问您解决了吗？？

  • 2022-03-04 16:25
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老师，第二次搜索结构域我们提取的结构域序列与最终三大数据库确定基因后提取的最终基因的结构域序列不一样是不是意味着错误

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利用snp找caps标记时出错

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课程“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”中，CoNet构建网络时按照操作步骤做出来初步网络的点和边的数量与课程中的不一致，是什么原因？

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请问从http://firebrowse.org/?cohort=BRCA&download_dialog=true 下载的甲基化数据，里面的甲基化探针cg号转换为基因名？

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群体课程里面 得到的Fst区间 如何合并区间并计算相应的Fst值？

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老师您好，如何将TCGA中下载的CNV数据：GDC_Aliquot转为Hugo_Symbol, Segment_Mean转变为拷贝数变异的5个离散值（0：无变化 1：拷贝数增加 2：高水平扩增 -2：纯合性缺失 -1：半合子缺失）。如下图所示

  • moli 2022-02-17 08:58
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老师您好，我最近在鉴定的一个基因家族，它没有专属的PF号，只有两个具有PF号的保守结构域，但是具有这两种保守结构域的不止这一类蛋白，hmm搜索筛查之后剩下了90多个基因，但是正常的家族成员应该只有20-40个，我可以用拟南芥里已知的成员做进化树来进一步筛选吗？

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老师您好，之前的链接失效了，可以麻烦您再发一次吗

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你好，请问如何将cg号转为基因名？

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qiime2的微生物16s全基因组序列的分析方法及思路

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HGMD数据库

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MEGA