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泛基因家族分析，Ka/Ks分析

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老师好，我在做gwas分析小麦时，按照脚本进行vcftools 过滤生成clean.vcf.gz 文件后出现以下问题，该如何解决

  • Max 2025-07-17 10:14
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你好，我在做小麦GWAS分析时，按照脚本过滤生成clean.vcf.gz文件，文件变得非常小怎么回事，修改过滤参数还是一样，到进化树分析时显示文件为空，有人能解答吗

  • Max 2025-07-15 11:10
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GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

  • 2025-07-11 23:22
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3 win11下，docker无法start

  • 2025-07-11 22:26
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STRING数据库映射出来的拟南芥基因号不是AT开头的

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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

  • Max 2025-07-09 17:50
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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

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老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

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泛基因家族分析家族成员存在缺失分析，获取PAV_gene.list和Fam_gene.list

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蛋白3D结构预测

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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

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windows安装Aspera Connect软件

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windows安装Aspera Connect软件

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reseqv2.0镜像annovar报错

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tassel导入表型数据和Q文件，一直报错格式有误

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

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treemix分析