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做MCScanX共线性分析提取不了蛋白序列文件

  • 2023-05-12 10:39
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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

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老师，我现在肠道菌群送检的数据有两个批次，用的引物序列不一样，在去除引物的操作中是分为两组去除吗，还是在一起去除两次，去除后如何合并两组处理后的数据

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docker toolbox启动报错

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你好老师，我是首次接触家族基因分析，数据从ncbi下载，想要转换一下格式，使用你的脚本，出现这个情况，该怎么办呀？

  • jay 2023-05-07 16:35
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PSMC结果是一条直线

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各位老师，为什么我的Manhattan图做出来只有一列？

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转录组数据分析

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5 老师您好，MEGAX构建进化树的时候弹出这个窗口是什么意思，要怎么调整我的序列？

  • 2023-04-30 02:23
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请问用cytoscape能计算出交互作用网络modularity的值吗

  • ## 2023-04-28 16:37
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在运行命令时出现segmentation default

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hmmersearch结果illegal character，请问是怎么回事

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你好，我想问一下，基因共线性分析，基因家族没标红您是怎么解决的呢

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你好，我想问一下，基因共线性分析，基因家族没标红您是怎么解决的呢

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老师 您好， 我在分析有参RNA-seq数据，hisat2-build 构建索引的时候遇到如下报错

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关于genome.repeat.summary 的问题

  • 2023-04-18 23:30
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进化树分析时报错，这是怎么回事呢

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samtools过滤多重比对的-F 256参数设置

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我是应该选择出现多个结构域的文件吗，重复是指第十八和十九条染色体上同一个位置相同结果出现两次，那我该怎么判断哪个才是我的基因家族的保守结构域呢

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admixture绘制群体结构图