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计算串联重复基因的KA/KS出现以下问题

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5 TCGA数据下载的时侯要有biotype_classs.txt

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老师，我在看菠萝的WRKY基因家族分析时，在看到基因组间共线性分析时有个词orthologous pairs不懂是指啥意思，原本我以为指的是红线菠萝WRKY基因家族，但是貌似不是这样的，请老师指点迷津

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制作染色体位置图和制作进化树分析图 和以及分析motif的意义是什么？有什么作用

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请问你用circos画共线性图时，怎样将设置让基因名称显示在圈外面

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预测基因顺式作用元件，提取序列失败

  • 2018-12-29 21:39
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串联重复基因分析

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5 在转录因子富集分析课程中，Q-value 是0，该怎样理解呢?

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5 get_gene_weizhi.pl 脚本修改

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基因家族分析课时20 比较基因组学分析最后一步生成图片时出现这个错误，无法生成图片

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5 raw data和clean data有什么区别？

  • 2018-12-29 15:34
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用什么软件可以直接画出染色体Ks值的箱线图？数据格式如下

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5 请问在把基因预测中，靶基因与转录因子关系中：tf_cor_target"NA",tf_target_cor显示NA，请问这是指什么？

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Perl脚本的解释

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老师好，我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染色体无法生成对比

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TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer

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Perl相关软件的安装

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5 基因家族成员如何取舍，命名？如何查找外显子和内含子结构？

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5 构建进化树出现问题

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老师好，我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Zj --cscore=0.7这一步出错，换下一个物种生成anchors文件为空，请老师指点