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请问在运行利用exprs()获取表达矩阵 exprSet = exprs(gset)时，报错Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘exprs’ for signature ‘"factor"’不知道什么原因？

  • 荣 2020-03-16 22:59
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mapman 非模式植物基因注释

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无法挂载怎么办呢？

  • ^O^ 2020-03-16 19:25
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5 No file mirdeep_runs/ tmp/precursors.fa_stack found

  • 2020-03-16 16:55
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5 请问基因表达模式折线图怎么画

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老师我用这个脚本文件提取基因的注释信息，为什么只能提取出CDS的位置信息呢，其他如外显子位置信息提取不出来呢？如下图，请问老师这是什么一个原因呢？

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老师你好， 一般来说，用hmmer搜索出来的结果和 blast出来的结果，哪个比较好一点呀？

  • yan 2020-03-16 12:33
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bio-linux中用hmmsearch遇到问题

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小麦基因组Un不能做串联重复的话，做大片段重复和共线性分析可以吗？还是Un序列上的基因只能以同源基因来说明，谢谢老师

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请问老师我做了一个植物 基因原核表达到载体里验证功能 验证这个植物基因TPS家族的一些基因。

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10 基因ID、cds ID与蛋白ID三者均不一致

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请问老师，在用tbtools做进化树，基因结构，motif三者图时，出现进化树基因有43个，但是基因结构图和motif图基因数只有36个是撒原因？？

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TCGAbiolinks包

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conda update CondaHTTPError: HTTP None

  • 2020-03-13 15:21
1 解决

5 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

1 解决

老师您好，咨询一下转录组和基因家族结合发文的问题

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老师您看，我通过ascp告诉下载下来的SRR 文件，他的压缩格式是.gz? 较普通的gz压缩文件多了一个问号，而且无法解压，也无法改名和移动路径，望老师解惑，这是怎么一种情况呢，谢谢老师!

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老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？

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做物种间共线性分析报错，请问哪位大神可以指点一下

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共线性分析

  • Li 2020-03-11 20:17