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服务器

  • Iron 2020-07-30 09:22
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基因家族分析中mcscanX共线性分析时，提取不了对应的蛋白序列

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请问如何用命令把基因组里blast得到的scaffold批量提取出来？

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老师您好。我删除虚拟机后重新安装，挂载失败。不能共享目录。protocol error

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老师，我看的大讲堂里geo的标准化的课程，课程里经标准化后基因的表达值变成（964319764916794；9）这种形式，每个R包都是这样，如截图所示为课程参考资料的文件，请问这是什么意思？（请您仔细看下截图，谢谢）

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请问在MEGA7.0中出现这种问题该怎么解决？ No common sites found

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5 老师，我用mapman对非模式作物进行基因通路注释，通过esembl biomart获得每个基因氨基酸序列，然后去官网制作mapping文件，在mapman软件进行注释，过程没有出现问题，也出了图，但是我点开某一通路，想看看有哪些基因的时候，我发现底下的基因注释与图中位置是不一致的，例如图中的ABA、JA，底下的Binname应该是和他们没有关系的吧？请问这是怎么回事

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老师您好。我删除后重新导入虚拟电脑，但是遇到了挂载不成功的问题。这是截图。还有提示protocol error。

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为什么我的bioLinux打不开.fa的文件呢

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在做MCScan出现了一下问题，求解

  • bobo 2020-07-28 19:08
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脚本perl ../script/get_mRNA_position.pl allmRNAID.txt ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 AT.gff

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报了基因家族鉴定的课，之前装ova的时候用的是官网的，但是很多软件没有。现在想重新装一下课程提供的含软件的ova。请问应该如何处理？

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请问各位老师，E-value（e值）设定的根据是什么？对结构域筛选影响很大吗？

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老师您好，知道拟南芥基因家族名称，也知道成员的基因名，怎样找到成员基因序列？谢谢老师

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老师，您好，我下载下geo原始数据，经标准化处理后，基因的表达值显示为 964316794613767；9 这是什么意思，不是说过表达值经log处理基本上在0-几十的样子，怎么变成这样了？这两个数字代表什么意义？

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老师，从GEO数据库下载的数据是标准化后的RNA-seq数据，能用哪个R包进行差异分析

  • ox 2020-07-27 11:05
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老师，我照着视频里的指令输入的，但报错了，请问有什么解决方法吗？

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R怎样读取下载好了的TCGA数据

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在进行共线性分析时，输入/biosoft/MCScanX/mcscanX/MCScanX mcscan/Put，提示说找不到文件，怎么回事，求解

  • bobo 2020-07-25 22:03
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为什么smart输出结果只是文本没有图呢