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mega构建进化树如何选择模型

  • 2020-09-28 17:12
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各位老师 计算KaKs时 加上空缺的- 总长度是2215 不是3的倍数 那该怎么办？

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老师，我在做完串联重复以后，发现成对基因互相比较的相似性、比对上的长度、还有其他值不一样是怎么回事（只有一对基因对是一样的）？不一样的怎么选择呢？

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老师您好，我初学生信，在使用KaKscauculator时需要用到paraAT，但是出现了问题

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paraAT运行不了是什么问题

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老师好，我想问kaks计算的时候出现报错，但仍然生成了结果文件，那这个值可靠吗

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建立基因组索引时gene_length文件出问题

  • Iron 2020-09-25 23:13
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10 有些GEO数据没发表论文/文章，可以拿来用吗？

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所有基因都只含一个相同的结构域，没有其他结构域了，这正常吗？

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比较基因组学作图

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10 请问有没有有关一个“科”物种转录组的汇总研究

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请问转录本绘图时，我输入了motif起始序列，但为什么结果图中未显示domain呢？（红色方块代表domain）

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按照课程筛选串联重复基因，找到了6对，然后绘制了circos图如下，但是发现我的这些结果应该都不是串联重复的呀，是我筛选错了么？还有就是根据课程用MCscanX分析基因加倍时候，得到的结果和用小兰老师方法得到的结果不同，是什么原因呀！

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GO富集分析

  • 荣 2020-09-23 01:14
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编号以TC开头的基因能在什么数据库里查到序列

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你好，之前看您想用转录组比对基因组数据，不知道是否有结果和方法

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WGCNA运行时报错：函数不适用。这是怎么回事呢？

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基因组索引

  • Iron 2020-09-20 14:18
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请问下面这张比对图是如何实现的？尤其是带有图下面 conversation这个分析的...

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FPKM值的理解困惑：双端测序时，一个fragements的两端都测序，结果是有两个reads，那在计算FPKM定义时，说Fragment的最终数目是Reads的1到2倍之间，不应该是reads是fragements的1-2两倍吗，