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虚拟机安装

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查找不同分组之间差异表达基因报错：没有DESeq2包

  • Iron 2020-10-14 10:14
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相同的序列文件，我跑总是跑不起，别人都能跑起，每次跑都会弹出下图的警告，老师，您看我是哪出了问题

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MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为0怎么办？确认配置文件没有问题

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9 以拟南芥CYP基因为参考序列，用BLAST寻找某一植物转录本中的CYP基因，如何操作？一条一条的对比吗？

1 解决

3 按照视频上操作的，为什么这个会报错，不能运行啊

  • 2020-10-13 11:09
1 解决

8 KA/KS计算得到的串联重复基因对与Circos图不一致

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合并不同样品表达定量结果all_gene_count.tsv文件出问题

  • Iron 2020-10-13 00:19
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您好 我使用GEO芯片数据课程的 download R文件下载 GSE80751和GPL17692时出现这个提示，运行后面的代码就会报错如图2，请问问题在哪里，怎么解决，谢谢！

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保守结构域

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vennerable 三维及以上如何实现按数据大小比例并自定义配色方案

  • 2020-10-12 16:15
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问一下老师们，提取成对基因的时候得到结果文件总是为空是什么原因，下面是我的输入文件perl ../script/KAKS_SHAIXUAN.pl -in1 WRKY_cds_confirmed.fa.fai -in2 WRKY_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out就是这条命令。

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老师，为什么我的新建的目录是 0ct ? 都是这种情况呢？

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5 用hmmer search搜索基因家族的时候，怎么也找不到结构域。怎么办，序列和代码都是对的。

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老师，您好，我在使用biolinux 解压文件时，显示出来的ignore

  • 2020-10-11 14:07
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10 求助WGCNA Hub基因选择问题

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老师，用视频教的方法用linux系统查找复制基因的时候，得到了duplication_gene.out文件，但是里边的成对基因不在同一染色体上，请问是我分析出了问题，还是它不属于串联重复基因，属于片段重复？下面这是操作过程我用到的文件：先进行了AABB30-cds的blast比对，得到图1的out文件，然后用了图3的程序，得到复制基因的，请问老师，这个是怎么回事

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用pfam搜到的基因构建进化树报错

  • LWX 2020-10-08 14:21
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老师，请问，用Evolview美化进化树时，在添加background colors for leaf labels，提示error: error: at least one valid colorset data should be given; data not upload/ updated是什么原因呢

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老师，您好，想问一下Evolview美化进化树怎么显示进化树标尺