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转录组数据下载

  • Llm 2019-08-23 09:38
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5 请问如果要对转录组数据里的基因家族进行分类统计，统计一共有几个基因家族，每个家族有几个基因的话，有什么方法或者工具可以做到？

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计算RPKM值时，公式中需要用到的基因的转录本的长度值具体是从哪个参考基因组相关文件和说明命令获得的？求步骤，谢谢！

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5 全长转录组为什么要构建混合文库？

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全长转录组是否需要打断，拼接？

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做无参转录组和有参转录组对服务器要求区别大吗？

  • 2019-08-09 11:30
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5 关于比较转录组的实验设计

  • 2019-08-05 10:16
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在鉴定长链非编码RNA分析中，合并转录本之后，如何批量从gffcmp.combine.gtf文件中提取class_code为i, u,和x的转录本?谢谢

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isoseq3流程reads数量问题

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5 二代转录组测序reads与基因组比对后，没有相应的注释结果，我们认为是新基因。在NCBI注释后，有些基因显示是参考基因组物种的注释结果，这种基因是新基因吗？

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组内某个生物学重复样品与其它相关性不太好怎么办？对文章发表有影响吗？

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5 无参转录组的组装的unigene数量比基因组测序出来的数量多，是因为有很多冗余的片段没有去掉吗？

  • 2019-07-12 17:24
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转录组取样应该注意些什么？

  • 2019-07-11 14:41
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5 如何用荧光定量验证转录组结果

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5 转录组数据分析，差异基因的功能在GO和其他数据库（NR, Swiss_port, Pfam）上有注释，但是KEGG上却没有，这是什么原因造成的，分析的时候应该以哪个为准，求前辈们指点

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5 你好，在rna-seq之后拿到GO注释，怎么找到所需要的基因

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二代测序和三代测序做转录组有什么区别？

  • 2019-06-26 09:45
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5 SRA数据上传无法继续

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5 转录组里具有相同功能注释的基因有上调的和下调的，那最后对应编码的蛋白到底是增加表达还是降低表达

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5 关于差异表达基因倍数