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5 根据HSF基因的pfam模型在转录组结果中找到很多基因，这些基因都是HSF吗？

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5 isoseq3 cluster 跑不出unpolished.bam

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5 如何在测序结果里搜索自己想要的结果或者说文件？

  • 2019-03-22 16:40
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fastq文件前面的预处理

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请问怎么用RNAseq获得的counts数据，再计算相应的FPRM值呢？求较详细方法或建议。谢谢了

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我只关注黄酮代谢相关的基因，能否只提取这部分基因来做差异分析？

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某基因在两个样本中表达量差别很大，分析结果却是非显著差异基因，这是为什么？

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老师，我想请问一下下面的这个文件里面的数据可以直接用吗？这是下载自对应植物基因组数据库的，就是一些基因在胁迫处理和各个组织器官中的表达量。其次我想问一下有什么方法可以知道这个文件来自那篇文献，这样我觉得有助于理解。

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老师，我想问一下直接从某植物对应的基因组数据库里下载的FPKM文件可以直接用吗？比如说里面有各个基因在各个组织器官上的表达量，我可以直接用里面的数据做热图吗？

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5 我想测小鼠的转录组，初次接触转录组，不知选什么公司，希望可靠一点的；不知用二代测序还是三代测序，有什么利弊吗？

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我的榆树转录组为什么没有可变剪接分析内容？

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5 基因启动子序列预测还有没有别的方法？课件里讲到的网站上没有我研究的物种。

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5 结合转录因子

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5 KEGG代谢通路图中的箭头竖线符号等是什么意思？

  • 2019-03-11 16:32
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5 用R的pathview函数下载KEGG信号通路图的时候报错

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5 热图

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转录组WGCNA分析中，要做模块与性状相关性图，怎么定义性状？

  • 2019-03-03 21:58
2 解决

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

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5 转录组学习中遇见的问题

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5 基因表达差异分析是使用FPKM还是用readcounts来计算显著性？

  • 2019-02-22 15:42