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老师，你好。在做有参转录组分析，转录本基因表达量出来之后，发现里面找不到我期待的同源基因（ID)，不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID，问题是这些ID在我的注释文件里根本没有，详细情况如下

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10 大佬们，想咨询个问题，如何从公司测回来的转录组数据找出自己想要的某个功能的差异基因呀？

  • 2019-09-26 14:19
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请问老师转录因子数据库，PlantTFDB为撒进不去啊，撒原因

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5 转录组的差异基因的注释

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KEGG通路图解释

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老师，我想做个转录测序然后进行一些分析实验，我想问一下我应该选哪个转录组课程啊？

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请问学习过有参转录组学的报告与解读，现在又做了无参分析，有必要再学一下无参转录组学的课程嘛？两者的分析区别大嘛？

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我做有参转录组数据分析，一共有30个样，每个样有3个重复。在做比对这一步时，我发现30个样中，有两个样，它们各有一个重复的比对率只有50％，而其他的样比对率均有80％以上，请问这样会对实验结果有影响吗？

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hisat2 reads 与基因组进行比对出错

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5 如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化？

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转录组基因表达差异分析分组问题，我是有3个样品数据，如下分别是Carambola_K007-01-T01（花序），Carambola_K007-01-T02（花苞），Carambola_K007-01-T01（叶），该如何分组呢

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最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，应该是脚本的问题，具体问题如下

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如何通过转录组测序结果geneID“TRIAE_CS42_6DL_TGACv1_527316_AA1702110”找到对应的“TraesCS4A02G403700”这样的ID？

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基因在不同组织的表达量做热图

1 解决

就是在学习RNA-Seq数据差异分析时，出现上调和下调都为0的情况，全都是没有差异的基因，是否需要修改参数设置？

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基因的表达量和转录本的表达量

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Isoseq3流程CCS报错

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三代转录组和二代转录组取样上有什么区别吗？

  • 2019-09-04 13:59
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edger差异分析，如何查询分组差异的结果

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5 原核转录因子预测