添加不上,报错了吗? 我们这个脚本会额外添加一列细胞分群信息到rds的metadata列里面,列名就是celltype
回答于 2024-05-20 09:38
输出的错误提示GFF3格式问题,你看看具体是哪个GFF文件报错了,检查一下; 上图截图的GFF文件我看看是正常的;
回答于 2024-05-17 17:12
你这个是软件安装问题。 请使用我们的docker镜像分析数据,我们的镜像安装好了软件就不会有这个报错了; 不然你需要安装bioperl这个包; 另外我们的课程已经更新,建议学习新本课程;https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
回答于 2024-05-17 17:10
如果太慢多给些线程--cores ; -k 值自己选择吧,不比较 运行到k 3 也可以;
回答于 2024-05-16 12:16
看看这个ndata这变量是否设置正确,和你的输入基因数量一致,打开mcmctree.ctl 文件看看的;
回答于 2024-05-16 09:27
警告一般忽略即可,如果觉得可疑,可以到GFF里面去搜索对应的ID看看格式是否有异常; 或者是nc RNA 就不用处理了;
回答于 2024-05-14 16:22