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对多个g.vcf.gz文件合并，遇到的问题？
超过500M的染色体，GATK 索引不支持； 1.解压g.vcf.gz 2. 解压后的vcf文件建立索引： gatk --java-options "-Xmx50g" IndexFeatureFile -I demo.g.vcf3.用解压后的g.vcf导入数据库 参考这里：https://www.omicsclass.com/question/7288
回答于 2024-05-22 10:39
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Docker 打开显示这个，但是我的wsl是新下的应该是最新的
按照报错信息更新 wsl，或者百度一下，或者购买我们的云服务器：https://study.omicsclass.com/index 省去安装的麻烦；
回答于 2024-05-21 17:38
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rnaseq分析中片段inner size出现问题
没有找到成对read的比对，你这个转录组是不是单端测序，单端测序没法评估这个； 或者你hisat比对的时候，输入read1文件和read2 文件，错误的都是输入read1 文件或者都是输入的read2 文件，检查命令行是否错误；
回答于 2024-05-21 09:52
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我得到转录组分析的wgcna数据需通过cytoscape筛选关键模块的hub...
这个权重值没有统一的标准，可以根据自己的需要选择多个筛选阈值，分析hub基因，直到筛选合适的； cytoscape也有一些插件可以帮助我们筛选hub基因：MCODE
回答于 2024-05-21 09:34
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repeat.summary.txt 文件为什么有的总类别有数据，如DNA，有的总...
DNA 那一行，是因为 属于DNA转座子但是没有子类； 其他的，比如LINE转座子，所有的都有子类；
回答于 2024-05-21 09:31
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ggplot2-气泡图-geom_point几何对象函数中点的颜色/大小映射的问...
如果要去掉图例的黑框添加代码： kegg_point + theme(legend.key=element_blank())
回答于 2024-05-20 10:17