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老师我做比较基因组的时候，准备文件阶段时用ncbi 下载的基因组...
高效的提问应该把所有输入文件以及命令行都贴一下图，最后再贴报错信息，初学者大多都是输入文件格式错误导致报错； 这个提示错误：这个脚本的路径写错了，你看看示例文件，改过来；
回答于 2024-05-14 11:14
单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑，应该调整...
可以用R语音读入RDS 文件手动修改输出PCA图片：https://satijalab.org/seurat/reference/dimplot library(Seurat)pbmc=readRDS("pbmc.rds")DimPlot(object = pbmc，reduction='pca')
回答于 2024-05-14 11:07
运行mcmctree报错2.0
高效的提问应该把所有输入文件命令行都贴一下，最后再贴报错信息，初学者大多都是输入文件格式错误导致报错； 看你的贴图： 输入文件格式问题吧，你把你的输入文件都贴图一下，检查是否格式错误导致软件报错； 这里标记化石时间错了，一般标记枝的分离时间(标记在括号的后面)，你这个标记到物种了，标记错了，你再看看...
回答于 2024-05-14 10:12
重测序
可以整理一个样本数据文件列表，第一列为样本ID，第二列为fq1的文件绝对路径，第三列为fq2的文件绝对路径；把for循环替换成while 循环； 例如： cat data-path-list.txt | while read i fq1 fq2;dobwa mem $BWA_INDEX $fq1 $fq2 -t 1 -M \ -R "@RG\tID:${i}\tLB:${i}\tPL:ILLUMINA\tSM:${i}" \ |samtools...
回答于 2024-05-09 12:06
扩增子：真菌ITS分析unite不匹配
是使用的我们的课程代码吗：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF 如果是的，你这个输入文件（ $dbdir/qiime2/unite_ver9_99_25.07.2023-Q2-2023.7.qza）写错了，脚本里面不是这个文件
回答于 2024-05-09 10:23