omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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Docker 打开显示这个，但是我的wsl是新下的应该是最新的

按照报错信息更新 wsl，或者百度一下，或者购买我们的云服务器：https://study.omicsclass.com/index 省去安装的麻烦；

回答于 2024-05-21 17:38

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有没有报错信息，没有的话重启试试的；

回答于 2024-05-21 15:45

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课程里面有的可以的，有的软件有PVE有的需要计算一下：https://www.omicsclass.com/article/2406

回答于 2024-05-21 15:43

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看看这个：https://www.omicsclass.com/article/1183

回答于 2024-05-21 15:42

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没有找到成对read的比对，你这个转录组是不是单端测序，单端测序没法评估这个；或者你hisat比对的时候，输入read1文件和read2 文件，错误的都是输入read1 文件或者都是输入的read2 文件，检查命令行是否错误；

回答于 2024-05-21 09:52

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这个权重值没有统一的标准，可以根据自己的需要选择多个筛选阈值，分析hub基因，直到筛选合适的； cytoscape也有一些插件可以帮助我们筛选hub基因：MCODE

回答于 2024-05-21 09:34

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DNA 那一行，是因为属于DNA转座子但是没有子类；其他的，比如LINE转座子，所有的都有子类；

回答于 2024-05-21 09:31

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如果要去掉图例的黑框添加代码： kegg_point + theme(legend.key=element_blank())

回答于 2024-05-20 10:17

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添加不上，报错了吗？我们这个脚本会额外添加一列细胞分群信息到rds的metadata列里面，列名就是celltype

回答于 2024-05-20 09:38

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你的这两段是重复序列（一样的序列），可能是细胞器基因组，或者其他，你再检查检查；

回答于 2024-05-20 09:35