警告一般忽略即可,如果觉得可疑,可以到GFF里面去搜索对应的ID看看格式是否有异常; 或者是nc RNA 就不用处理了;
回答于 2024-05-14 16:22
高效的提问应该把所有输入文件以及命令行都贴一下图,最后再贴报错信息,初学者大多都是输入文件格式错误导致报错; 这个提示错误:这个脚本的路径写错了,你看看示例文件,改过来;
回答于 2024-05-14 11:14
可以用R语音读入RDS 文件手动修改输出PCA图片:https://satijalab.org/seurat/reference/dimplot library(Seurat)pbmc=readRDS("pbmc.rds")DimPlot(object = pbmc,reduction='pca')
回答于 2024-05-14 11:07
高效的提问应该把所有输入文件命令行都贴一下,最后再贴报错信息,初学者大多都是输入文件格式错误导致报错; 看你的贴图: 输入文件格式问题吧,你把你的输入文件都贴图一下,检查是否格式错误导致软件报错; 这里标记化石时间错了,一般标记枝的分离时间(标记在括号的后面),你这个标记到物种了,标记错了,你再看看...
回答于 2024-05-14 10:12
可以整理一个样本数据文件列表,第一列为样本ID,第二列为fq1的文件绝对路径,第三列为fq2的文件绝对路径;把for循环替换成while 循环; 例如: cat data-path-list.txt | while read i fq1 fq2;dobwa mem $BWA_INDEX $fq1 $fq2 -t 1 -M \ -R "@RG\tID:${i}\tLB:${i}\tPL:ILLUMINA\tSM:${i}" \ |samtools...
回答于 2024-05-09 12:06