omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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ParaAT 多序列比对报错 2.0

这个需要测试查看你的输入文件是不有问题；光从你的描述我也不好推断原因；这些异常的基因都去看看删除一下试试，还有就是文件不要在windows下用记事本修改导致文件兼容问题；编辑用专业的工具并设置：https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2024-04-19 17:59

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那些太短的scaffold去除一下，太多染色体circos会报错；展示染色体就行

回答于 2024-04-19 17:56

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输入的vcf文件格式问题吧，你检查输入文件看看有没有异常

回答于 2024-04-19 11:18

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看看运行过程中最后有没有报错吧，如果最后有killed字样就表示内存不够导致系统杀死了任务；

回答于 2024-04-19 11:09

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数据质控，一般测序公司会给质控好的；

回答于 2024-04-18 18:34

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我看命令行没有问题，可能你的电脑没有联网吧，你再试试的；

回答于 2024-04-18 18:33

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可以的，你可以先把双端的用flash 软件合并成单端的，再和单端的合并一起用qiime2 导入分析

回答于 2024-04-18 18:29

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理论上影响不大，因为引物也是扩增子的一部分，但是如果你的引物有简并，最好还是去除一下；

回答于 2024-04-18 15:24

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可以再检查看看的，可能你没看到吧；

回答于 2024-04-18 14:43

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需要先建GO KEGG注释库，之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2024-04-17 23:12