对的,这是phylip文件格式的限制,样本名字最多10个字符,多出的字符自动截掉了,你可以自己修改一下样本名字再分析这部分内容;
回答于 2024-06-04 17:32
确保是同一套基因组,如果有对应列表可以对起来;如果没有建议你下载原始fastq文件做一下你的参考基因组的转录组分析: 这里有视频课程你可以看看:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM
回答于 2024-06-04 09:59
这是最后一行吗,你看看后面是否还有其他染色体; 如果只有一条染色体,你看看前面分析数据的是不是有问题,比如参考基因组是不是只有一条染色体?
回答于 2024-06-03 09:32
没生产文件,看看有什么报错吧; 没在windows下用过这个,建议用我们的docker分析吧:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
回答于 2024-05-30 12:40
换一种安装方法: git clone https://github.com/velocyto-team/velocyto.py.git cd velocyto.py python3 setup.py install 如果有包包错没有,可以直接用pip安装: pip3 install Cython pysam loompy
回答于 2024-05-29 09:33
你的命令行应该改一下,怎么还是Hind III呢,当然跑步过去了; mboI 和dnpⅱ 两种酶切位点一样,用哪个都行;
回答于 2024-05-28 16:32
可能是由于选择的差异分析方法和筛选条件太严格,导致没有找到差异的marker基因,你可以换个方法,并且降低筛选条件,例如: Rscript $scripts/seurat_FindAllMarkers.r --rds $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \ -p FindAllMarkers --test.use wilcox --logfc.threshold 0.2 例如这里有文献用M...
回答于 2024-05-28 09:46