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老师您好,做完蛋白序列多序列比对后,分析基因家族的保守位点,...

多看看自己研究的家族保守结构域的特点,再看看比对后序列上保守的碱基就知道了; 例如下面的,WRKY比对结果,一看WRKY就知道了: 再对比一下 WRKY保守结构域的motif,就知道了,红色箭头处保守的氨基酸:

回答于 2024-05-28 09:42

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老师您好,亚细胞定位预测出来的结果很多,需要都写上吗

一般选第一个就可以;

回答于 2024-05-28 09:36

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老师请问,这种OG0000.。。代表的基因家族扩增还是收缩问题,他...

家族的收缩和扩张看后面的数字是正负,正扩张,负收缩; 至于具体是什么家族,需要做找到家族对应的基因序列,做功能注释才行;

回答于 2024-05-28 09:34

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docker 运行报错

看你的容器没有在运行,你的docker容器启动命令行是不是有问题,你可以贴一下帮你看看; 这里解决,你可以先删除容器再重新启动一个容器; docker rm -f 858a00217673 #删除容器;

回答于 2024-05-28 09:31

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老师我想问一下这个挂载是不是有问题呢

可能是端粒,你看看具体的序列;端粒是重复序列你可以用软件鉴定一下,这个课程里面有: https://bdtcd.xetslk.com/s/nr634

回答于 2024-05-27 09:15

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挂载过程中遇到以下问题需要怎么处理

可能是内存不够吧,你多给些内存给docker:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-05-27 09:06

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基因组注释中重复序列注释

最好用近源的,不然遗传背景远注释出来的结果相对少;

回答于 2024-05-23 17:55

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基因家族分析--结构域在线数据库中确认

可以去并集,只要有一个数据库有就认为这个基因含有这个结构域;

回答于 2024-05-23 16:36

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在进行物种累积丰度曲线时提醒没有该命令

sh脚本前面有个export开头的命令需要运行一下,添加环境变量,shell才能找到这个脚本;

回答于 2024-05-23 09:13

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做基因家族共线性分析时,collinearity文件是空的,可能是什么问...

有些物种是没有的,有可能的; 一般动物里面会少或者没有; 你再检查检查你的输入文件是否正确吧

回答于 2024-05-22 10:52