修改进化树名字可以参考:https://www.omicsclass.com/article/675 ID少的话手动在nwk文件里面修改就行,用notepad++或者editplus打开nwk文件就可以;
回答于 2019-10-18 09:56
建议使用evolview编辑美化进化树,里面有批量修改颜色:https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-10-17 20:52
看到有编码错误,建议不要在代码中出现中文,处理中文很麻烦; 另外统一一下编辑器的编码格式为utf-8; Rstudio主要是用来编写和运行R语言代码的,python代码编写运行建议用pycharm。 生物信息少走弯路建议学习: 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数...
回答于 2019-10-17 13:31
你的配置文件写错了吧,建议你看看官方的说明:http://circos.ca/documentation/tutorials/ 看看 HIGHLIGHTS 部分
回答于 2019-10-17 10:27
参考一下别人是如何描述问题的:https://www.omicsclass.com/question/1280 这样我们才好帮你发现问题,解决问题;
回答于 2019-10-16 18:07
里面应该有模式动植物的互作网络,建议用你丹参的基因同源比对一下拟南芥的基因,看对应的拟南芥基因是否有互作关系,再映射到自己的基因上;
回答于 2019-10-16 18:04
一个物种的所有蛋白互作关系都在数据库里面,你想得到特定的,搜索一下对应的ID号就好了;
回答于 2019-10-16 10:26
需要完全对应上才行,你再检查检查,或者截图我们看看ID; 还有就是bed里面列之间是否只有tab空白,如果有空格你删除一下;
回答于 2019-10-16 10:20
这是软件mapchart绘图的原因,两个基因放在了一起。判断串联重复基因要用科学的方法才行:https://www.omicsclass.com/question/1
回答于 2019-10-15 12:04
看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/1429/answer/1800 检查bed文件中的染色体ID与seqids文件中的ID是否一致
回答于 2019-10-15 11:51