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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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Mapchat导入文件不能作图

基因位置顺序按照从小到大排列,报错那个基因你调整一下位置; 参考:https://www.omicsclass.com/article/397

回答于 2019-10-06 10:46

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老师您好,我在用vi打开并修改文件后无法退出,就是在安装MCScan...

vi按esc键进入命令模式之后,按 ZZ 保存退出 linux基础不好,加快学习进度建议学习:linux系统使用 里面都有详细讲解;

回答于 2019-10-06 10:43

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下面R语言while循环中为甚输出的不是最后一个值?

x为向量,索引每运行一次 i  就会增加,所以x的索引在不断的变化,不同的值存在不同的位置,最后x 为向量输出; R语言学习建议:R语言快速入门与提高

回答于 2019-10-06 10:41

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R中apply同时计算行和列使用c(1,2),为什么不起作用

那说明一次只能计算一种,不同同时计算行列;

回答于 2019-10-06 10:38

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老师好,我想问一下,RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢?rea...

read counts是测序之后每个基因测到的reads数量,可用于做差异分析,因为做差异分析的软件要求输入原始reads数;例如DESeq2等等; FPKM和TMP,RSEM等都是对reads进行标准化,只是计算方法不一样:https://www.omicsclass.com/article/615,方便比较; 因为一个基因测到的reads数量与他的基因长度,表达量,测序数据量有关...

回答于 2019-10-06 10:38

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关于mcscan问题

按理来说氨基酸序列和cds序列都是可以的,只是不同的软件支持输入的文件不一样,我们课程是安装软件的使用说明来的,你也可以自己去看软件官方的使用说明。或者尝试换一种序列试试; 

回答于 2019-10-06 10:32

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老师您好,我在安装MCScanX时,按照手册修改好了三个文件,make...

你重新安装吧,可能哪里修改错了:https://www.omicsclass.com/article/104 安装方法见:https://www.omicsclass.com/article/275

回答于 2019-10-06 10:29

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基因家族分析文章:筛选时为什么选用基因组数据库的编码蛋白,而...

基因组已经已知,很多基因的蛋白质氨基酸序列已经知道,我们是搜索蛋白序列上的结构域序列,而不是用蛋白质组技术鉴定;

回答于 2019-10-06 10:23

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使用bio-linux中sratoolkit里prefetch下载数据,但是无法打开试...

环境变量biolinux为Ubuntu系统见:https://www.omicsclass.com/article/387 软件安装不知道你安装是否正确,如果安装正确需要把软件的安装目录添加到环境变量中,才可以像你截图一样使用; 具体可以学习::linux系统使用  里面有解释软件安装与环境变量设置;

回答于 2019-10-06 10:13

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进化树美化问题

可以试试新版本的evolview:https://www.omicsclass.com/article/963

回答于 2019-10-02 08:05