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TCGA数据库下载数量不对

case是癌症病人编号,有时候一个癌症病人取样时同时取了多个组织(例如原发癌组织,转移癌组织,血液对照等),后期做实验一个case 多个组织都可能有实验数据,因此会存在文件数多于case数的情况,属于正常。

回答于 2019-11-19 15:06

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关于WGCNA拓扑聚类热图的求助

颜色是不是取反了,你检查一下; 

回答于 2019-11-19 12:46

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根据蛋白质序列的批量Go注释和富集

需要手动blast批量比对注释才行;blast2GO就可以

回答于 2019-11-19 12:45

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WGCNA表达基因

可也把一些表达量低的基因,或者变化不大的基因提前删除掉;

回答于 2019-11-19 12:43

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GWAS分析模型的选择

你是做遗传图还是GWAS? GWAS一般用自然群体就行,不用人工群体; 如果用GWAS关联人工群体,  由于是人工群体遗传背景单一,理论上不需要考虑群体结构,可以采用简单的GLM线性模型关联;

回答于 2019-11-19 11:41

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老师你好,共线性分析问题

看看你的bed文件里面的基因ID与cds里面的ID是不是能互相对应;

回答于 2019-11-19 11:37

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共线性分析出错

看报错最后: 检查配置文件,里面的Me.bed 文件里面基因的起始 结束位置是不是有问题:

回答于 2019-11-17 14:16

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BSA分析算法中利用ED算法进行分析,发现没有计算出来初定位的区...

不同的方法会有差异,正常的;

回答于 2019-11-17 14:13

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NCBI上传数据中的libraryID是什么?

这个不知道就随便取一个吧。 如果想知道咨询测序公司

回答于 2019-11-17 14:12

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软件无法使用

请安装我们百度云盘提供的biollinux 包:https://www.omicsclass.com/article/526  里面有安装这些软件;

回答于 2019-11-17 14:11