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有个问题想请教一下大家，从数据库中下载的原始数据的gff文件，...
大部分是通过一些软件根据基因的特点预测出来的；例如： 参考文献：https://www.nature.com/articles/s41559-017-0120
回答于 2019-10-24 10:28
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Tbtool中Quick Mscanx Wrapper使用的时候总是得不到结果
没用过tbtools 做共线性分析建议使用MCScanX之间分析：https://www.omicsclass.com/article/275 或者观看基因家族分析课程，里面有详细的使用教程： 《基因家族分析实操课程》
回答于 2019-10-23 12:01
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gzip: Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.45.gff3: Protocol error
看看文件是否下载完整，重新下载文件吧；
回答于 2019-10-23 11:59
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Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for w...
当前目录没有写的权限，挂载共享目录的时候不要勾选只读分配； https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2019-10-22 14:43
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想问问进化树外面的各个亚族的环是怎么做的，第二就是树枝末端的...
可以使用evolview在线工具完成：https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-10-22 09:50
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请问用TBtools在进行 进化树+基因结构+motif—1张图全显示的时候...
进化树里面的ID和gff里面的ID一致就好了，我看你的ID不一样，你修改一下就好了； GFF格式你要了解一下，ID是哪个课程里面有详细讲解：：基因家族分析实操课程
回答于 2019-10-22 09:47
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老师你好，blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out...
不同的筛选方法（blast手动筛选法，MCScanX软件筛选方法），筛选的条件有区别，可能得到不同的结果，以一种方法为准即可。
回答于 2019-10-21 15:46
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