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哥，您好，如何检查GFF文件里面的mRNA ID是否对应一致，或者如...
脚本认为ID=与；之间的为gene或mRNA的ID，建议你把GFF文件里面的gene: CDS: transcript: 删除； 然后再看看fasta里面的ID与GFF里面的ID是否一致。 这样保持所有地方的ID一致，就不会因为找不到对应的ID而出错。 如果上面按照我说的都改了，脚本这里27行就可以删除gene： 获取ID信息了：
回答于 2019-11-08 10:22
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ggplot，超过12种颜色，scale_color_brewer(type="seq",palette=...
这是ggplot2里面内置的色板，如果颜色不够可以使用手动设置色板scale_colour_manual()：https://ggplot2.tidyverse.org/reference/scale_manual.html 颜色的获取可以参考：https://www.omicsclass.com/article/746 学习R语言基础与绘图：、R语言画图、R语言快速入门与提高
回答于 2019-11-08 09:36
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为什么预测基因家族顺势原件位置信息出来是空表
检查GFF文件里面的mRNA ID是否对应一致。 参考这个：https://www.omicsclass.com/question/1941
回答于 2019-11-07 10:04
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基因 定位到染色体时，获取染色体的位置信息报错[fai_build_core...
可能你的fasta文件不是标准的格式，你看看Chr2序列折叠之后长度是否一致；
回答于 2019-11-06 17:46
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用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so rev...
建立索引这一步很消耗内存，几百G以上内存的节点运行一下试试；
回答于 2019-11-06 14:46
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基因家族加倍复制时，blastall所有基因比对所有基因，程序运行了...
运行时间和电脑的配置与基因的数量有关。如果电脑性能差，基因数量大，运行会慢一些，耐心等待。 2018年买的5000元的笔记本电脑，40000 vs 40000基因比对，大概运行一天时间，你可以参考一下；
回答于 2019-11-04 17:09