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4110 个回答

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老师,您好,我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的三个方法中...

看看这个:https://www.omicsclass.com/question/3682 内存不足

回答于 2021-01-14 13:38

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老师,您好,我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法...

电脑内存不够,系统自动杀死了进程; 建议至少16G以上的内存才可以运行, 。 docker  中内存调整:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2021-01-14 13:37

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脚本参数--minsize=0 --minspan=30

上面 那个是分析原理,20个基因 对应这个minspan; cscore   :C-score is defined by the ratio of LAST hit to the best BLAST hits to either the query and hit. A C-score cutoff of .99 effectively filters the LAST hit to contain reciprocal best hit (RBH). minspan:  这个值越大  得到的结果中共线性区...

回答于 2021-01-13 10:39

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基因家族分析

三种结构域分别分析,最后再合并分析; 再有再多看看文献,看看这三个结构域的关系,多了解这个家族自然就会有分析思路了;

回答于 2021-01-13 10:18

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您好,老师,我这段代码想实现个循环,可只输入fd文件的第一个数...

不建议这样写代码,建议把fg文件里面想要的内容读到字典中,再逐行循环fd和字典;

回答于 2021-01-13 10:16

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关于VirtualBox中biolinux挂载共享文件夹的问题

你的命令写错了,你再看看共享文件夹挂载方法:https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2021-01-13 10:11

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在基因家族分析过程中,确定结构域的时候发现一个算是该基因超家...

可以看看定义,自己取舍:https://www.omicsclass.com/article/1306

回答于 2021-01-12 14:38

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老师好,想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后,几天后为什么...

可以使用本地版本的meme分析motif,见基因家族课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp

回答于 2021-01-12 14:37

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重复文章代码出错

你的输入数据有问题吧

回答于 2021-01-12 14:36

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有了基因的ID后,如何批量获取这些基因的染色体所在,以及这些基...

可以到GFF文件中去查找; 想要批量获取,可以学习linux命令,或者编程:perl python等,下面的课程都有的; 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语...

回答于 2021-01-04 18:14