安生水
eQTplot包绘图报错解决：“Caused by error in `db_collect()`”
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-06-30 09:52
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每天学习一点点
omicsgene
idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
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- omicsgene
- 发布于 2024-09-29 17:18
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)
数据介绍： 来自谷歌翻译： 肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...
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- omicsgene
- 发布于 2024-10-31 14:05
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组装"预实验" | 基因组调研图
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度，为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小，倍性，杂合度，重复率等方面去进行评价。 用什么来...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-30 15:39
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Ti Amo
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
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group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组，然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-08-07 10:46
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
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- omicsgene
- 发布于 2024-07-22 18:21
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R语言绘制多分组差异分析结果图
R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据
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- 安生水
- 发布于 2024-10-25 13:52
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HiC-Pro 报错检索解决
报错： 运行HiC-Pro的时候出现报错： 去看log文件发现： 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找： 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-28 15:12
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安装R包出现链接库缺失的问题
unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so': libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...
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- xun
- 发布于 2024-10-24 10:35
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xun
SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-09-09 16:31
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单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中
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- omicsgene
- 发布于 2024-08-29 13:40
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