“ 2025年2月Frontiers in plant science 杂志发表了一篇题为“ Pan-genome analysis and expression verification of the maize ARF gene family”的泛基因家族文章。” 本研究基于玉米泛基因组...
《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架
通常来说,进行图片绘制的时候如果存在数据分布差异过大的情况,我们更倾向于选择坐标系截断(gg.map等)的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息,如果想要更加全面...
非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建
当我们想在linux下批量处理数据时,用到的脚本需要达到我们想要处理的效果,这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说,一些生信脚本是非常晦涩难懂的,google百度得到的回答也...
Cactus 是由 UCSC(加州大学圣克鲁兹分校) 开发的 全基因组比对工具(Whole Genome Alignment, WGA),采用 层次化比对算法(Progressive Alignment),能够高效处理跨物种或同物种的基因组比...
如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式
单细胞转录组文章
https://openssl-library.org/source/old/3.0/index.html
deepseek绘图之--FPKM小提琴图
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法: 1. vim 打开二进制文件: vim -b 文件 将内容转换成16进制: :%!xxd 转换回来: :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。 但是,有相当一部分研究人员由于是初次接触宏基因组分析,对分析结果缺乏系统的了解,无法高效的挖掘和研究目的相关的结果,进而影响了文章的发表以及成果的转化。
python代码到pubmed上搜索关键字,统计每年发文章数量
使用Copilot自动在Rstudio中写代码
研究探讨了不同饲养策略对甘巴羊生长性能及肠道微生物群落的影响。通过宏基因组和qPCR分析,发现不同饲养策略显著改变了微生物群落的多样性和组成。同时评估了与植物多糖降解相关的酶基因
在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了
我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...
clusterprofile 支持的物种GO和KEGG富集分析orgdb
比较基因组单拷贝直系同源基因数量
AI 写代码之绘制GWAS 曼哈顿图