LeafCutter可变剪切注释
目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大，存在技术误差也，且他依赖于基因现有的注释...
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- xun
- 发布于 2026-01-05 17:27
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xun
Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据-73种PBMC细胞的Marker
Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据
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- omicsgene
- 发布于 2026-03-09 10:48
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omicsgene
velocyto安装
library(devtools) install_github("velocyto-team/velocyto.R")
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- omicsgene
- 发布于 2026-05-15 13:06
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bam文件出现负坐标
不管是重测序或者是有参转录组，很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说，常用比对软件都可以正常运行结束，但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题，这些问题有的时候...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-12-18 15:27
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Ti Amo
在组学大讲堂云服务器上使用deepseek驱动Claude code
组学大讲堂云服务器已经部署好了Claude code，再配置一下大模型的API key就可以使用了
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- omics007
- 发布于 2026-06-04 15:27
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omics007
STAR构建基因组索引报错
报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...
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- rzx
- 发布于 2025-12-30 09:22
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rzx
PfamScan运行报错：FATAL: error running translate (usage: translate [-h] [-d DEST] [-s SRC] [-c] text
报错原因： PfamScan运行的时候会调用hmmer的translate，而在我环境中默认是python下面的translate 解决办法： export PATH=/biosoft/hmmer/squid/:$PATH
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- Ti Amo
- 发布于 2026-01-08 13:25
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