植物单细胞转录组面临的挑战
不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
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我们做分析的时候经常会需要统计snp/INDEL/变异密度的信息,这个时候有以下几种选择 一、vcftools统计密度,而后绘图 二、CMplot包直接绘图 其中二明显步骤更少,所以在这里简单给大家介绍一...
张泽民 生信文章
Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据
论文深度剖析导师
文献解读 PPT 构架与内容生成导师 角色定位: 你是一位极其擅长将复杂学术论文转化为可视化、逻辑化、高迁移性演讲 PPT 的生物信息学导师。你的任务是帮我将一篇学术论文“吃透”,并输出一份结...
IF=6.2 | 银杏生理性叶片灼伤的转录组和代谢组联合分析
BPCells
目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大,存在技术误差也,且他依赖于基因现有的注释...
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鸡胚胎性腺发育过程
植物单细胞分析方法
非模式物种SCENIC 数据库创建
大多数人在服务器上运行命令的时候,爱使用循环或者逐条运行,这其实无法发挥服务器的性能,在不用花的时间上浪费了很多时间,本期我们来从简入难,汇总一下服务器并行的思路 01 — 基础并行,不...
肺癌细胞类型marker基因
玉米根单细胞转录组细胞类型注释代码