宏基因组的基因组binning(分箱,即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中)是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...
单细胞转录组数据挖掘流程记录-LUAD(GSE123902)
IF=4.8 | 不同耐旱性小麦品种在干旱胁迫下的转录组代谢组联合分析
“ 2026年1月Genome biology杂志发表了一篇题为“Multiomics profiling reveals the adaptive responses of largemouth bass to high temperature stress”的多组学分析文章。”大口黑鲈是重要经济...
在一些群体遗传进化的文章中,会展示整合了物种分类和大量系统发育推断(灰色虚线)的进化树,接下来小编将绘图代码贴在下面,效果如下图: 1.准备数据 准备3个文件,其中两个nwk格式的树文件...
“ 2025年12月 Frontiers in plant science杂志发表了一篇题为“Genome-wide characterization of WRKY family genes in four araceae species and their expression analysis in Amorphophallu...
如何写出好的 Skill
单细胞转录组拟时序-monocle3分析代码
使用filezilla时,比较常见的报错是Access denied,可以按如下顺序进行检查: 1、检查主机地址是否正确?组学大讲堂的主机地址是:sftp://omicsclass.com 2、检查密码是否正确,复制密码后可...
IF=4.2 | 杏黄李关键耐寒代谢途径的转录组代谢组联合分析
GATK SPARK 环境安装
报错内容: ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下,基本上是这个脚本的第六行存在调用: ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...
小鼠单细胞转录组方法
一. 报错 在运行ggtree脚本的时候出现报错: Error in `stat_tree()`: ! Problem while converting geom to grob. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `is.waive()`:...
华大DNBC4单细胞转录组
在真核生物里,基因转录出来的是 pre-mRNA(前体 mRNA),里面包含外显子和内含子。在变成成熟 mRNA 的过程中,内含子会被切掉,外显子会被拼接起来,这个过程就叫 剪切(splicing)。而可变剪...
IF=10.5 | 转录组代谢组学分析揭示了玉米对盐碱胁迫的响应机制
monocle3手动选取细胞发育轨迹分析
玉米根尖热处理单细胞数据分析
R 包安装QS