omicsgene
LeafCutter可变剪切注释
目前主流的探究转录组数据的可变剪切的算法是基于estimate isoform ratios 或者 exon inclusion levels ,但是可变剪切本跟正常转录本重合的比例很大，存在技术误差也，且他依赖于基因现有的注释...
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- xun
- 发布于 2026-01-05 17:27
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xun
Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据-73种PBMC细胞的Marker
Science上的健康中国人群PBMC的单细胞测序数据
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- omicsgene
- 发布于 2026-03-09 10:48
- 阅读 ( 354 )
IF=9.4|多组学解析大口黑鲈高温胁迫适应机制
“ 2026年1月Genome biology杂志发表了一篇题为“Multiomics profiling reveals the adaptive responses of largemouth bass to high temperature stress”的多组学分析文章。”大口黑鲈是重要经济...
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- rzx
- 发布于 2026-03-02 09:22
- 阅读 ( 353 )
rzx
可变剪切绘图 | rmats2sashimiplot
在真核生物里，基因转录出来的是 pre-mRNA（前体 mRNA），里面包含外显子和内含子。在变成成熟 mRNA 的过程中，内含子会被切掉，外显子会被拼接起来，这个过程就叫 剪切（splicing）。而可变剪...
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- Ti Amo
- 发布于 2026-02-27 12:00
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Ti Amo
STAR构建基因组索引报错
报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...
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- rzx
- 发布于 2025-12-30 09:22
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PfamScan运行报错：FATAL: error running translate (usage: translate [-h] [-d DEST] [-s SRC] [-c] text
报错原因： PfamScan运行的时候会调用hmmer的translate，而在我环境中默认是python下面的translate 解决办法： export PATH=/biosoft/hmmer/squid/:$PATH
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- Ti Amo
- 发布于 2026-01-08 13:25
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ggtree报错：Error in `stat_tree()`
一. 报错 在运行ggtree脚本的时候出现报错： Error in `stat_tree()`: ! Problem while converting geom to grob. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `is.waive()`:...
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- Ti Amo
- 发布于 2026-03-18 15:21
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IF=13.8 | 柬埔寨活禽市场环境监测与传统监测在病毒检测效能上的对比研究
“ 2026年1月 BMC Microbiome杂志发表了一篇题为“Environmental metagenomics enhances detection of circulating viruses from live poultry markets in Cambodia ”的宏基因组分析文章。” 01...
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- xun
- 发布于 2026-02-28 17:23
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python读取 Perl's Config::General module.
python读取 Perl's Config::General module.
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- omicsgene
- 发布于 2026-03-08 16:19
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