报错: 运行cactus-pangenome的时候报错: [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...
10X 单细胞原始数据下载
兰花发育中器官发生的时空图谱数据下载示例
ANNOVAR是一款功能强大的基因组变异注释软件,由王凯博士开发,广泛应用于遗传学研究和临床诊断领域。它能够对基因组中的变异位点进行多功能注释,帮助研究人员理解变异的生物学意义。最近使用...
IF=4.8 | 联合转录组与代谢组分析揭示了硒对百合生长和品质的影响
从华为云的对象存储服务OBS下载测序数据
“ 苔藓植物全世界约有22000种。迄今为止,55个苔藓植物目中只有8个进行了基因组测序,为了进一步了解陆生植物基因组进化过程,这篇文章测序、组装并注释了123个高质量且高度完整的苔藓植物基因...
USB挂载到KVM虚拟机
一文教你绘制GO富集分析弦图,简单又好看
GATK SPARK 环境安装
多组学联合分析—桑基图
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在一些群体遗传进化的文章中,会展示整合了物种分类和大量系统发育推断(灰色虚线)的进化树,接下来小编将绘图代码贴在下面,效果如下图: 1.准备数据 准备3个文件,其中两个nwk格式的树文件...
不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下,eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达,sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...
在群体遗传学中,选择清除、连锁不平衡和单倍型是三个紧密关联的核心概念,它们共同帮助我们理解自然选择如何在基因组上留下印记。今天先来说说选择清除分析。 一、 核心概念解析 选择清除:...
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进行gsea分析的时候需要gmt文件,需要到官网进行下载。官网需要注册一下才可以进行下载。 官网网址:https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp 直接进入http://www.gsea-msigdb.org/gsea/d...
宏基因组的基因组binning(分箱,即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中)是一个关键步骤, 常用的软件是2018发表的metawrap,但是他一直没有更新, 这篇文章将介绍一个较新的binnin...