在泛基因组研究中,结构变异(SVs)的检测是揭示物种内遗传多样性的关键环节。相比单核苷酸多态性(SNPs),结构变异能够解释更多的表型差异和适应性特征。今天我们就来深入探讨泛基因组分析中...
2025年2月 GigaScience杂志发表了一篇题为“The telomere-to-telomere genome of flowering cherry (Prunus campanulata) reveals genomic evolution of the subgenus Cerasus”的基因组组装文章...
空间转录组动力学分析
人免疫细胞marker基因
cactus-bin-v2.9.9 安装笔记
SAW 空间转录组参考基因组制作
报错: 运行cactus-pangenome的时候报错: [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...
feature 重要性排序棒棒糖图
基因结构图是基因组学研究中最基础的可视化之一,它能帮助我们直观展示基因的外显子-内含子结构;定位突变位点、SNP位点在基因中的位置;展示不同转录本的结构差异。ggbio是基于ggplot2开发的基...
不同物种构建泛基因组的时候需要用到Progressive Cactus 参考文章:Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomic 下载: 软件github:https://github.com/Comp...
KEGG GO 富集显著性图 名字太长,柱状图上文字解决
10X 单细胞原始数据下载
兰花发育中器官发生的时空图谱数据下载示例
单细胞分析 质控 线粒体 红细胞 核糖体
SCP FeatureDimPlot 报错
seurat subset之后再聚类报错:
KEGG 通路基因列表;
ANNOVAR是一款功能强大的基因组变异注释软件,由王凯博士开发,广泛应用于遗传学研究和临床诊断领域。它能够对基因组中的变异位点进行多功能注释,帮助研究人员理解变异的生物学意义。最近使用...
从华为云的对象存储服务OBS下载测序数据
IF=4.8 | 联合转录组与代谢组分析揭示了硒对百合生长和品质的影响