在线绘制聚类热图(heatmapper)

在线绘制聚类热图的方法,3分钟学会!

聚类热图是转录组测序类文章中常见的一种分析内容。今天小编就给大家讲解一个在线绘制聚类热图的方法。

我们使用的在线工具网址:

http://www.heatmapper.ca/expression/

打开后的页面是如下所示:

attachments-2019-04-UNgZdZAy5cbe664b510f0.jpg

该在线工具有几个优点:

1、支持不同的颜色配置;

2、支持样品和基因的双聚类;

3、支持基因名称的显示;

4、支持多种格式图片的下载。

绘图之前,需要准备相应的数据文件。在这里小编使用的是基因的表达量数据来绘制聚类热图。

attachments-2019-04-BArtdf4C5cbe6677630d0.jpg数据文件准备好之后,需要把该文件上传,上传完成之后需要稍等片刻(在线工具有延时),右侧图形展示区域就会显示聚类热图。再根据右侧参数进行相应设置即可完成聚类热图的绘制。

attachments-2019-04-ZmU8747o5cbe668767a65.jpg如果基因数目比较多,基因名称显示会不清晰,我们可以将图片下载下来,然后再使用其他软件进行修改,比如使用AI进行修改。

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  • 发表于 2019-04-23 09:14
  • 阅读 ( 1519 )
  • 分类:科研作图

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