5 Seurat 直接读取的表达矩阵可以是经过log2plus1和normalizaed to 10,000 counts per cell的矩阵吗?需要转化成raw count吗?

attachments-2020-09-4GCtCPiD5f50f1d12fc23.png在GEO里下的处理后的表达矩阵,是经过标化和scale的,如图,请问这种矩阵可以直接作为seurat的对象吗


请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GEO的数据标准化之后是可以直接使用的;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,2774 浏览
  • AzuraAva 提出于 2020-09-03 21:40

相似问题