44家机构联合破解巨型鱿鱼基因组!

哥本哈根大学牵头,44加机构联合破解巨型海怪基因组!但是看完文章我很失望!

​在古代的航海记录里,除了暴雨、巨浪这种恶劣环境之外,也少不了恐怖海怪的传说。

attachments-2020-03-4kD1QfJf5e74b20d3fae9.png

数只巨大的触手从海面下飞出,像钢索一样把小木船绞成几段,这种场景也成为了很多电影的经典镜头。
巨型鱿鱼Architeuthis dux)无疑是这种海怪的原型之一。

attachments-2020-03-20kwEtRy5e74b213e66be.png

不好意思,放错图了,应该是下面这种:

attachments-2020-03-j69jl9sr5e74b219b9037.jpeg

据记载巨型鱿鱼平均体长在10-12米之间,最长可达20米!不过至今人类仍未捕获到活的巨型鱿鱼,我们对它的了解基本来自偶然冲上海滩的尸体或者商业捕捞打捞上来的尸体。我们对这种巨型头足类生物的各种习性知之甚少,更不用说分子生物学特性了。

44家机构合作破解巨型鱿鱼基因组!

近期由丹麦哥本哈根大学牵头,由44家科研机构共同破解了巨型鱿鱼的基因组,研究成果于今年年初发表在《Giga Science》上,算是一个好的开端。文章里有不少篇幅描述了基因组的组装、注释等常规内容,在此就不赘述了,有兴趣的同学可以根据文末的参考文献自行下载研究。小编重点和大家聊聊文章里关于几个重要基因家族的研究。

  1. 特化的性状通常伴随着相关基因家族的复制和扩张,巨型鱿鱼既然长这么大,研究人员自然研究了下两个重要的、生长发育相关的基因家族——WNT和HOX。然而巨型鱿鱼在这两个家族上并没有发现明显的扩张,其巨大的体型在这个角度上没有得到答案;
  2. 原钙粘蛋白(protocadherin)家族通常认为和神经发育相关,在多数无脊椎动物中数量都不多,一般在17-25个之间,但在头足纲中,该家族发生了明显的扩张,通常能够达到100个以上,难怪头足纲的生物在无脊椎动物中算智力比较高的。本文在巨型鱿鱼基因组里鉴定到了135个家族成员,这和其他头足纲同类相近;
  3. 最后作者还鉴定了一个头足类所特有的基因家族——反射素(reflectins),该家族可编码色素蛋白,与其体表变色密切相关。作者鉴定到了7个反射素基因和3个类反射素基因,不过也没有进一步的分析了。 

看完本文,小编还是有点失望,巨大体型没有找到基因组水平的解释,原钙粘蛋白和反射素也是头足纲共有的特性,关于巨型鱿鱼本身的亮点不多,还是希望后续有人能对这种有趣的生物做更深入的研究,比如口感怎么样之类的。

参考文献:Brejova B, Albertin C B, Silva F, et al. A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux[J]. 2019.


延伸阅读:

1. 国宝吃竹子并非发自内心

2. 龙的基因组公布啦!

生物信息专业培训点击进入

  • 发表于 2020-03-20 17:06
  • 阅读 ( 58 )
  • 分类:基因组学

0 条评论

请先 登录 后评论
omics007
omics007

27 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 306 文章
  2. 安生水 215 文章
  3. Daitoue 168 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. CORNERSTONE 42 文章
  6. 红橙子 39 文章
  7. 生信老顽童 37 文章
  8. landy 37 文章