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网易云课堂WGCNA-加权基因共表达网络分析问题

• WGCNA

• 冯说的是 2018-12-15 15:16:56

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WGCNA分析基因筛选

• 基因筛选
• 基因过滤
• WGCNA

• 宋达 2018-12-14 11:21:41

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在做WGCNA分析时，已经找到最相关的模块，想要用其中的lncRNA和基因根据pearson's correlation coefficients做一个热图（行为lncRNA，列为基因），但是根据 课程的代码并没有看见这部分计算的结果在哪里，不知道这个pearson's correlation coefficients如何计算？谢谢~

• WGCNA

• 张婷婷  2018-11-20 10:36:19

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做WGCNA分析时，modules数量多少时结果较为理想？

• WGCNA

• 生信老顽童 2018-11-15 20:38:32

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在做WGCNA分析时，生成的模块数量过多，且模块之间的相似性不高，如何减少模块的数量？

• WGCNA

• 张婷婷  2018-11-14 11:03:26

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构建网络是用所有表达基因还是差异基因？

• WGCNA

• 生信老顽童 2018-11-12 08:50:55

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在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

• WGCNA

• 张婷婷  2018-11-11 21:06:48

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在RStudio中安装WGCNA包后调用WGCNA包提示错误

• R
• WGCNA
• 包
• 安装

• chen 2018-11-10 17:56:32

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WGCNA分析进行模块和性状相关性分析时，trait文件如何做？

• trait文件准备
• WGCNA

• Maggie 2018-11-02 15:26:46

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WGCNA分析中模块与性状正负相关性的意思？

• WGCNA

• Maggie 2018-11-01 16:01:44

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请问一下，就做了一个转录组测序，样本是不同的组织，能否用WGCNA分析分析，写个文章？

• WGCNA

• 邹先炎 2018-10-30 15:21:42

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WGCNA的样品不少于15个，15个样品考虑重复吗？

• WGCNA

• 生信老顽童 2018-10-22 19:22:59

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Rstudio进行WGCNA分析时无法输出GS和MM值表格，无法输出cytoscape nodes edges文件

• WGCNA

• Maggie 2018-10-13 22:02:52

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WGCNA分析没有给出powerEstimate，如何选择power值/β值？

• WGCNA

• Maggie 2018-10-13 14:32:54

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Rstudio读不出文件中的数据

• WGCNA

• Maggie 2018-10-13 11:46:33