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文章 噬菌体表面展示技术原理及四大分类详解

...表面。被展示的多肽或蛋白可以保持相对独立的空间结构生物活性,以利于靶分子的识别结合。肽库与固相上的靶蛋白分子经过一定时间孵育后,洗去未结合的游离噬菌体,然后以竞争受体或酸洗脱下与靶分子结合吸附的噬...

文章 envfit()的线性拟合:非约束排序(PCA、CA、PCoA、NMDS)

...一种线性的方法。由于envfit()只能与vegan包中的排序函数一起配合使用,下文对四种常见的非约束排序(PCA、CA、PCoA、NMDS)都简介一下。 #加载 vegan 包library(vegan) #读入物种多度数据phylum <- read.delim('phylum_table.txt', row.names =...

文章 2022年基因家族第1篇—大型动物基因家族分析怎么写?!

...一篇2022年1月11日见刊的介绍牛中Wnt家族分析的SCI文章,一起了解下动物基因家族分析都写哪些内容! 文章简介 Wnt信号通路广泛存于无脊椎动物脊椎动物中,是一类物种进化过程中高度保守的信号通路,Wnt信号动物胚...

文章 STAMP使用(组间差异)

...torey’s FDR控制FDR的新方法,比BH更强。需要估计一些参数更多的计算资源。 选择适合样本方法绘图:可看到两组样本中哪些功能具有显著差异及P值大小。 (5)保存图片,建议pdf格式。 此外,我们网易云课堂上有...

问题 Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异,Adonis检验P值小于0.05,怎么看结果?

Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异,图中分不开,但是组间距离显著性分析PERMANOVA,anosimpermdisp,以及Adonis检验P值小于0.05,这样结果怎么看?

问题 请问我跑一个perl脚本,怎么限定它服务器的线程呢?因为没有限定线程服务器好响啊,之前有些脚本会提前用-T指定线程,可是这个脚本是我自己写的,突然不知道怎么限定线程了,谷歌没找到答案,求救于此

文章 cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

...网络与高通量基因表达数据其他的分子状态信息整合一起,其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA遗传交互作用的分析。 通过Cytoscape,可以可视化的环境下将这些生物网络跟基因表达、基...

文章 淡黄的长裙,蓬松的头发?拿什么拯救你,我的项目

...进行高效的项目管理。这几天一直有朋友后台问我 怎么项目做的好好的突然就延期了,项目验收时,又因项目质量不符导致项目无法正常验收! 那么如何才能提高项目管理的效率,实现高质量项目交付,我们必须要明白...

文章 最新2区转录组文章!看人家是怎么写的!

...人却仍可以游走2区行列,人家是怎么做到的呢?我们一起去看看! 文章简介 该文章是6月21日发表BMC Genomics(IF=3.594,中科院分区:2区)的一篇研究拟南芥春化作用冷驯化关系的转录组文章,下面我们一起看一下这篇...

文章 生存分析的Cox回归模型(比例风险模型)R语言实现及结果解读

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

问题 想问一下用做药物作用后的itraq标记质谱分析蛋白的变化?对照组是113114,实验组是115,116,117,那如果得到了115/113,116/113,117/113,115/114,116/114,117/114这些都是实验组与对照组倍数变化fold change 以及他们对应的p值,那我怎么用,筛选的时候要用这六个比值的均值吗?还是有其他的筛选办法?还有六个p值应该如何来筛选?

问题 老师,为什么我得到的Fam_gene.list中大多都是独有的,特别是参考基因组,全部都没有同源基因,那么我接下来结构变异与基因结果保守结构域分析时,无法比对,该怎么往下做呢?

...结构变异与基因结果保守结构域分析时,无法比对,该怎么往下做呢? 另外,下面泛基因构建部分得到的列表final.last.gene.pair.txt,例如基因Seita.3G066400明明是有同源基因的,为什么最后得到Fam_gene.list却没有?我按照老师的指令...

问题 用新代码提取的treefile文件motif,基因结构一起绘图报错。

文章 mirDeep2的使用

...nt数,结果同样可以用网页打开查看 第四步:鉴定已知未知的miRNA miRDeep2.pl Total_reads_collapsed.fa  Myzus_persicae_O_v2.0.scaffolds.fa Total_reads_collapsed_vs_genome.arf \   mature_ref_this_species.fa mature_ref_other_species.fa \   precursors_ref_this_specie...

文章 linux之sed用法详解

...印,亦即将某个选择的资料印出。通常 p 会与参数 sed -n 一起运作~           s  ∶取代,可以直接进行取代的工作哩!通常这个 s 的动作可以搭配正规表示法!例如 1,20s/old/new/g 就是啦! 例子: sed '2,$d' file           #删...