基因家族分析植物中非常常见，动物多见鱼类等海洋动物，牛羊等大型动物的基因家族分析文章比较少，那么大型动物能不能整理基因家族分析类文章呢？答案是肯定的，今天，我就给大家介绍一篇2022年1月11日见刊的介绍牛中Wnt家族分析的SCI文章，一起了解下动物基因家族分析都写哪些内容！

文章简介

Wnt信号通路广泛存在于无脊椎动物和脊椎动物中，是一类在物种进化过程中高度保守的信号通路，Wnt信号在动物胚胎的早期发育、器官形成、组织再生及癌症在内的人类疾病等生理过程中，具有至关重要的作用。

Wnt蛋白是Wnt信号通路的启动子，由一个富含半胱氨酸的分泌糖蛋白家族组成，在人、小鼠、果蝇、粟顶螟、豌豆蚜、蚊子、蜜蜂等中系统鉴定过，但是在牛中仍未见系统报道，所以作者对8种牛科动物进行了全基因组水平鉴定和进化分析，并利用转录组数据和qPCR分析了牛脂肪细胞分化过程中不同组织和阶段的表达谱为进一步阐明Wnt蛋白在脂肪细胞分化中的潜在功能奠定基础。

文章内容

1. 牛科Wnt蛋白家族家族鉴定

作者用blast和HMM两种方法在牛(Bos taurus)、牛(Bos indicus)、杂交牛(Hybrid-Bos taurus)、杂交牛(Hybrid-Bos indicus)、牛(Bos grunniens)、牛(Bos mutus)、牛(Bubalus bubalis)和野牛(Bison Bison)共8种牛基因组中鉴定Wnt蛋白，鉴定结果如下：Bos taurus(19), Bos indicus (17), Hybrid-Bos taurus (19), Hybrid-Bos Indicus (19), Bos grunniens (19), Bos mutus (19), Bubalus bubalis (19) and Bison bison bison (18)，不同牛基因组中Wnt家族数量稍有差异。下图为s Bos taurus中Wnt家族基因详细信息。

2. Wnt蛋白家族基因进化及结构分析

作者用19个牛Wnt家族基因保守结构域序列构建系统发育树并与基因结构图和Motif分析整合为一张图。

3. 不同生物间Wnt家族成员系统发育关系

为了探究牛科Wnt家族基因功能分化，作者用8种牛Wnt家族保守结构域序列和人、小鼠Wnt基因一起构建系统发育树。

4. Wnt家族成员染色体分布和基因组间共线性分析

8种牛科动物均作图。

5. 不同组织Wnt家族基因表达模式分析

作者在反刍动物基因组数据库和NCBI搜集到来源60个组织的163个转录组数据，分析Wnt家族基因在不同组织中的表达特征，重点分析脂肪细胞组织中Wnt表达情况，并发现Wnt基因在肌内脂肪细胞和皮下脂肪细胞中表达模式相似，于是作者接下来利用皮下原代脂肪细胞对Wnt基因表达进行验证。

6. 牛皮下原代脂肪细胞的分离及诱导分化

作者分离牛皮下原代脂肪细胞并进行诱导分化，利用染色及分化标志基因(PPARγ, C/EBPα and FABP4)验证诱导成功。

7. qPCR验证Wnt基因在脂肪细胞分化中的表达分析

利用上一步分离的皮下脂肪细胞验证Wnt基因及Fzd受体基因在分化不同时间点（0，2，6和10天）的表达模式变化。

总结

以上就是该篇牛Wnt家族分析文章的全部结果内容，分析工作量不算小，但还是常见的分析内容，经费投入也不高，烧钱的也就仅是qPCR部分，周期短，文章好整理，你还不来一篇！

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牛Wnt家族分析原文链接：https://www.nature.com/articles/s41598-021-04468-1

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