reshape2包melt函数对数据进行整合，比较常见的就是利用ggplot2包进行图片绘制的过程中往往需要对数据进行整合，melt()的使用方法如下：加载R包以及案例数据 library('reshape2') dat type sample1 sample2 sample1 sample21 A 6.33...
...位图的，譬如常见的tiff、png、jpg等格式的图片文件。 如何利用Adobe illustrator(一下简称Ai) 将矢量图pdf文件或者svg文件转换成tiff等文件呢？ 1、打开Ai ，由文件--打开--选择相应要转换的pdf文件 打开结果如下： 2、导出tiff /p...
> sample_type <- "Primary Tumor" > # 该癌症总样品数量 > samplesDown <- getResults(query.met,cols=c("cases")) > cat("Total sample to download:", length(samplesDown)) Total sample to download: 582 > # 下载甲基化数据，数据非...
...的相关性，通常的做法是利用表达量数据计算皮尔逊相关系数，然后设置一定的阈值进行筛选，再进行一些图形展示。 以下用一个例子带大家了解一下R计算相关性常用的两种方法： 我先模拟两个数据集，有两组样本A和B，每...
...定perl来运行，例如如2： 对于perl新手来说，理解起来比较难，建议使用第一种方法运行perl脚本就行，可以忽略这一行，甚至脚本中不写这一行也行； 更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分...
...的范围也就如下）： 2、 σ（总体标准差）未知，且为小样本（一般样本量小于30，很多生物研究类实验样本量往往少于30且σ未知），则选择t-分布：t*也是通过t-检验查表获得，其数值与置信度以及自由度（n-1）有关（此处适...
...最大传输速度，一般200m到500m，如果不设置，反而速度会比较低，可能有个较低的默认值 -k 断点续传，一般设置为值1 -Q 用于自适应流量控制，磁盘限制所需 -P 用于SSH身份验证的TCP端口，一般是33001
...因是3892起始，但是注释文件并不是，个人觉得这个问题比较严重，麻烦您尽快解答一下！
...t或者EList，后两者涉及芯片数据标准化过程，此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。 指定数据如下：相同type取均值 > dat type Num1 Num21 A 90 892 B 34 323 C 56 534 D 99 9...
...有MeV软件、Excel、R语言ggplots绘图等等，今天给大家介绍如何在Hiplot网站中绘制热图，只需要导入固定格式的数据文件，就可快速输出聚类热图。 绘制热图是Hiplot的基础模块功能之一，除此之外，也可以绘制转录组数据分析中常...
...过去，2019年的转录组文章到底该怎么写？难or易？ 这里小编给您带来一篇2019年1月21日发表在BMC Plant Biology（影响因子3.93，中科院分区二区）上的转录组测序文章。该篇文章样品不多，思路明了，分析简单，没有过多的复杂的补...
...一些更简单、更有可能得出积极结果的事情， 比如一个小小的实验、或者一次小长跑等等。 即使是微小的成功，也能让你在漫漫几个月毫无进展的过程中都鼓舞到自己的士气，让自己感觉有所收获。 4，你一定要明白：科研...
...：https://www.ncbi.xyz/geo/query/acc.cgi?acc=GSE250521 10X的空间数据比较重要的两组文件，一组类似单细胞数据barcode，feature，matrix 三个文件组成的表达矩阵文件，另外的就是空间图像信息文件了，json为不同尺寸图片的缩放文件，images 分...
...饰、定量蛋白质表达水平。质谱分析会得到大量的数据，如何利用软件及算法对质谱下机数据进行充分挖掘，高效、精准分析是研究的关键环节。 为了助力科研工作者深入了解蛋白质组质谱数据分析方法，提升相关分析能力，...
...err包，eulerr包的优势在于可以用面积大小代表元素数量（比较适合3个集合的venn图，绘制4个集合可能会有bug）： # 加载eulerr包 library(eulerr) # 定义集合的大小和交集的数量 # 假设集合A、B、C的大小分别为： size_A <- 10 # ...