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string数据库下载的文件表头比较复杂,我给大家写一份说明书

1,neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中,两个基因是否靠近彼此,通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个基因在某些物种中距离非常接近,那么它们被认为是相邻的。

2,gene_fusion: 这个特征表示两个基因是否在同一个蛋白质中融合在一起。这种融合通常由基因重排或基因突变引起,可能会对蛋白质功能和相互作用产生影响。

3,phylogenetic_cooccurrence: 这个特征表示两个基因在不同物种之间是否经常出现在同一基因组中。如果这两个基因在很多不同物种中都出现在相同的基因组中,那么它们被认为是具有共生进化的。

4,homology: 这个特征表示两个基因之间的序列相似性。如果两个基因之间的氨基酸序列非常相似,那么它们被认为是具有同源性的,这意味着它们可能具有相似的功能。

5,coexpression: 这个特征表示两个基因是否在同一个生物系统中同时表达。如果两个基因在同一个组织中同时表达,那么它们被认为是具有共表达关系的,这意味着它们可能具有相似的生物学功能。

6,experimentally_determined_interaction: 这个特征表示两个基因是否已被证明在实验室中相互作用。如果两个基因在实验室中被证明可以相互作用,那么它们被认为是具有已确定的相互作用。

7,database_annotated: 这个特征表示两个基因是否在公共数据库中被注释为相互作用伙伴。如果两个基因在公共数据库中被注释为相互作用伙伴,那么它们被认为是具有已注释的相互作用。

8,automated_textmining: 这个特征表示两个基因是否通过文本挖掘方法被发现可能相互作用。如果两个基因被发现在同一文本中提及,并被认为可能具有相互作用,那么它们被认为是具有自动化文本挖掘的相互作用。

9,combined_score是基于多个特征的加权分数,用于评估两个基因之间可能的相互作用强度。这个分数是通过对多个特征进行综合评估得出的,具体的评估方法可以根据具体的研究或分析需要而有所不同。通常情况下,这个分数越高,表示两个基因之间的相互作用可能性越大。

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