...=116.3 on 24 df, p=4e-14 n= 304, number of events= 60 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣,请学习我们的TCGA相关课程: 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《WGCNA加权基因共表达网络分析》 《GEO芯片数据挖掘》 《GSEA富集分析》
...性与男性的风险比(HR)。性别的β系数= -0.53表明在这些数据中,女性的死亡风险(低存活率)低于男性。 危害比例。指数系数(exp(coef)= exp(-0.53)= 0.59)也称为风险比,给出协变量的效应大小。例如,女性(性别= 2)将危...
...piens.GRCh38_release104.genome (ERR): hisat2-align exited with value 1 数据用的是trim_galore进行数据过滤的,Hisat2已经构建好索引,1/2指定路径准确,fq.gz文件完整,改SRR1039508根据SRA数据库得知为双端测序,但是一直是这样的错误,不知道怎...
...ks grape.cacao.i1.blocks --noheader | cut -f1,2,4,6 > grape.blocks 筛选关注的区域进行展示,这里展示前50列: $ head -50 grape.blocks > blocks2 blocks2文件格式如下: GSVIVT01012261001 . . GSVIVT01012259001 ppa005716m . GSVIVT01012258001 . . GSVIVT01012257001 ppa...
...件:meme.xml,提供对应基因蛋白序列的motif结构信息 导入数据与设置 打开软件,点击上方Others——BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer 进入数据导入界面(见下图A)。绘制三图合一,只需要输入三个文件即可,分...
我看到有的文章使用的表达之经过Zscore,我想问下老师您对这样的方法有了解嘛?谢谢老师!
...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
...基因表达的均值,由于单个细胞之间存在异质性,这样的数据丢失了细胞与细胞之间的差异信息。而单细胞技术能够检测到混合样品内单个细胞的表达谱,弥补了传统测序技术的缺陷。注:单细胞测序技术示意图 目前的单细胞测...
...区域是否受到选择。这里要用玉米材料的群体基因组变异数据和大刍草群体基因组变异数据,并且大刍草的样本和玉米的样本都是回帖在同一套参考基因组上。去年发表的一篇文章,整理了很多前人已经测序的玉米和大刍草样本...
想问一下您“GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析”这篇文章里的最后一个图片出自哪个文献啊?想参考一下。谢谢
...示,第二列并不是某一条染色体,我想是我的樱桃基因组数据组装的原因,我想请问,这种情况还能继续往下做分析吗?第二列数据是代表什么呢? 我继续使用tiquxulie.pl时,出现下图报错: 如图所示,我看我的问题是提...