
for sample in ERR12165622 ERR12165623 SRR8437784 SRR8224150;do
vg giraffe -m pangenome.min
-d pangenome.dist
-Z pangenome.gbz
-f \(datadir/fastq/\)sample_1.fastq.gz
-f \(datadir/fastq/\)sample_2.fastq.gz
-N \(sample -t 32 >\)sample.gam
用这个命令比对的时候,怎么一直在增加内存,都增加到167g, 还在增加,如下图:
有什么方法可以减少内存的使用? 另外,我的样本有200个,能不能并行运行?