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蛋白质组测序过程中搭桥是什么意思？
所谓搭桥就是内参。 由于itraq或tmt技术上的限制，最多标记10个样品，所以，当样品数超过10个的时候就需要设置内参，以矫正不同批次之间的批次差异。 比如：做18个样品，则可以做成两个10标的，每组9个样品加1个内参（内参是多个样品的混样），总共需要做的样品数就是9+9+1+1=20个。 当然，设置内参需要考虑的因素很多，...
回答于 2018-07-26 12:00
蛋白质组学文章中差异倍数选择相差很大，有没有一个标准？
目前公司分析大多数是按照差异倍数2倍进行分析的，但是由于差异蛋白的数目一般不会很多，所以我们要根据实际情况，对差异倍数做出合适的调整，前提是差异是真实存在的即可。在文章发表当中，没有谁规定差异倍数必须是多少。 其实在转录组测序中也没有硬性规定。 我们做分析的时候要学会灵活处理，不要墨守成规！合适的才...
回答于 2018-07-25 20:56
外泌体检测方法
在外泌体研究中，外泌体鉴定是继分离之后的又一关键步骤。分离到的“外泌体”是否有较典型的外泌体结构？是否表达特异性的外泌体表面Marker？大小是否落在外泌体常规的粒径范围？这些都是外泌体研究所需要考虑的问题。一般情况下，研究者会综合运用各种检测手段来对分离物进行最终界定，而在这些手段中，外泌体透射电镜观察以...
回答于 2018-07-16 10:36
蛋白组组学分析中：iTRAQ/TMT与Label free的优缺点
iTRAQ/TMT特点： 1. 通量高，平行比较多达10个样品； 2. 灵敏度高，重复性好； 3. 覆盖度高。 Label free特点： 1. 无需同位素标记试剂； 2. 不受样本条件的限制，但准确性受到质谱重复性等因素的影响。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文...
回答于 2018-07-16 10:33
一般动植物进行转录组测序，要测多少数据量，如何估测？
植物一般测6G数据，如果基因组较大，比如甘蔗小麦甘薯等，则需要测8G以上。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转...
回答于 2018-06-29 06:48