生信老顽童
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相同材料不同处理之间,可相同材料不同处理之间,可以放在一起做...

可以将不同处理的样本,合并在一起做分析。WGCNA的方法关注的是调控关系,所以不管是多少个处理组,都可以很好的整合在一起做分析。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看...

回答于 2018-09-13 11:37

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做Itraq或TMT蛋白定量分析,植物叶片需要最少多少组织样品?

一般来说单次提取需要200mg左右的组织样品,但是不同的物种其蛋白含量不同,也有十几毫克就能提出足够的蛋白的。所以,在可能的情况下,多的准备组织样品,如果样品实在太少的话,可以准备一份试提的样品,试提一下看看效果。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速...

回答于 2018-09-06 13:05

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有参转录组测序分析,各个样品的数据与参考基因组的比对效率多高...

与参考基因组的比对效率与多个因素有关,包括基因组组装质量、测序质量、有无污染等;一般来说,与参考基因组的比对效率在70%以上时,该基因组可以满足后续的分析需求。当比对效率低于60%时,需要考虑换参考基因组或者按照无参转录组分析策略进行分析。 但是,比较特殊的情况得特殊情况特殊处理。分析得灵活。 更多生物信...

回答于 2018-09-04 12:54

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做BSA混池定位时,如果分离群体中隐性基因致死,没有纯合隐性植...

没有隐性植株是无法做BSA混池定位的 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)...

回答于 2018-08-23 08:33

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三代全长转录组适用的情况,无参还是有参?

三代全长转录组针对有参和无参都适用。 有参的可以鉴定异构体,分析可变剪切等 无参的可以做为参考,构建全长转录本。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击...

回答于 2018-08-17 10:49

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目前三代全长转录组测序建几个文库?

目前三代有两种:一种是很多公司低价在推的,建一个混合文库,不区分片段大小,这样成本低,但是检测出来的短片端转录本会很多;另一种是建两个文库,1-4k、4-10k。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读...

回答于 2018-08-10 06:39

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无参转录组中unigene和转录本的区别?

unigene是转录本的子集。首先通过triniy组装出来的视为转录本,然后挑选最长的一条转录本作为unigene。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解...

回答于 2018-08-08 15:40

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所研究的物种没有全基因组序列,能否做蛋白质组学分析呢?

没有参考基因组的物种也可以做蛋白质组学分析,一般我们会先看其近缘物种有没有参考基因组,如果有的话,可以考虑使用。或者我们对所测样品做一个转录组测序,使用转录组构建一个简易的蛋白库作为数据库使用。如果二者都没有的话,那就不建议做了,结果会非常不准确的。

回答于 2018-08-02 17:30

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做iTRAQ/TMT蛋白组学定量分析,不同老师的样本可否放在一组上机...

不同老师的样品或者同一个老师不同实验的样品,都不能放在一组上机。 原因:不同的物种的话,在搜库的时候选择的数据库不一样,无法进行搜库比较。 同一个物种的不同处理的话,那么经过不同实验室处理后,样品里的蛋白含量和数目会有较大差别,混在一起后会影响两组不同来源的样品的蛋白鉴定数目

回答于 2018-07-28 16:40

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Itraq和TMT的区别?

iTRAQ和TMT是两种不同的定量技术,其实二者只是不同厂家生产的(iTRAQ是AB SCIEX研发,TMT是Thermo Fisher研发),在标记规格、标签分子结构上有些许差异,其他原理基本一样。 在可以混标的数量上,Itraq是4标和8标的,TMT是2、6、10标的。 Itraq的报告基团113-121,中间没有120,一共8个 TMT的报告基团是126-131,其中1...

回答于 2018-07-28 16:36