生信老顽童
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221 个回答

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用samtools call出单个样本的rawvcf文件,合并之后发现samtools...

call SNP主流都是用GATK,虽然会慢一些,但是认可度很高。用samtools的都是为了省事,途快,一般都不用这个的。建议你重新使用gatk做一下吧。

回答于 2024-02-21 09:08

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我做群体结构研究

请使用我们的镜像进行分析,有些脚本是打包到镜像中了。

回答于 2023-10-28 16:34

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动植物比较基因组

可以学习我们的课程https://bdtcd.xet.tech/s/1BdOpW

回答于 2023-10-13 08:24

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各位老师好,请问无参转录组(没参考基因组)做基因家族分析能发...

无参的可以做基因家族分析, 只是和染色体或者基因结构的分析做不了。比如共线性分析、基因结构分析、染色体定位等。后续也是做些定量验证、亚细胞定位等试验即可。有兴趣的话,可以微信联系18510686562详聊,我们组学大讲堂可以做相关分析服务。

回答于 2023-10-04 13:40

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mRNA_to_geneid.pl从哪里下载的

在基因家族分析课程里有下载说明,课程链接:https://bdtcd.xet.tech/s/1xkBdl

回答于 2023-08-18 14:53

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各位老师,想请问一下注释文件Gb格式如何转化成Gff格式呢?

https://www.omicsclass.com/article/2035可以参考这个试试

回答于 2023-08-07 09:38

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docker进行RNAseq分析,GO和KEGG聚类分析获得气泡和柱形图,镜像...

你检查一下你的镜像是否使用正确,还有数据格式是否正确。

回答于 2023-08-05 16:38

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做真菌有参转录组测序,mapping值很低。

和参考基因组比对率低,那大概率是菌株污染了。你可以自己查一下样品

回答于 2023-08-01 17:43

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老师您好,我想请问我的种源地不知道,做完群体遗传,从进化上看...

那你得做GWAS关联分析,就可以找到和性状相关的关联位点,然后就可以得到候选区间和基因。

回答于 2023-08-01 17:42

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各位老师好,我在使用geneid_to_mRNAid脚本提取自己基因组gff文...

你查看一下基因ID是不是一致。

回答于 2023-07-29 11:32