生信老顽童
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190 个回答

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老师您好!物种里面只能在ncbi找到全基因组数据,只有fna和gbff...

没有gff文件的话,你找这个基因组的作者要一下,如果要不到的话,就没有办法了。

回答于 1天前

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BSA分析,野生型亲本,抗性混池

如果没有报错的话,那就要看看你的材料是不是有问题。是不是严格按照mutmap的方法构建的分离群体。

回答于 1天前

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请问如何升级虚拟机系统里的Python3?

用虚拟机的话,就不要更新安装了。我们现在都不用虚拟机了。可以尝试用docker或者直接在电脑上装个linux的系统,然后再装自己需要的软件。 或者,直接租用我们的云服务器使用。云服务器链接:https://zzw.xet.tech/s/1iQaM8

回答于 1天前

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共享文件一直挂载不正确

不要用biolinux了,用docker吧。

回答于 2022-11-23 08:35

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docker镜像下载一般需要多久?

网络正常的话,几十分钟一般就下好了。如果一直不动的话,可能是你网络的问题,换个时间,或者换个网络试试。也或者,继续等。

回答于 2022-11-23 08:33

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MENA网站上传数据提示错误

提示不是说了,让你给网站发个邮件说明一下么。你就发邮件问问呗

回答于 2022-11-18 15:16

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vcf文件中染色体名字更换

这个ID不是替换的问题,染色体是通过挂载得到的。你这个基因组组装的就没有到染色体,应该就是contig水平的基因组,就无法替换成染色体。除非你测个HIC或者做个光学,然后自己挂载一下染色体。

回答于 2022-11-18 15:15

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转录组学数据可否直接引用

已公开发表的数据,可以直接引用结果的。说明清楚就行。

回答于 2022-11-09 10:55

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求教各位老师:请问为何测序公司三代转录组测序给出的CDS有很多不...

这个三代测序:1、不一定都是全长的转录本 2、有些测序会测到基因上游的一些序列或者内含子序列

回答于 2022-11-09 10:52

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序列ID在gff3中找不到,要怎么解决

你看看你的GFF3文件和你的基因ID是不是一套基因组文件,如果不是一套的话,肯定找不到。

回答于 2022-10-30 15:49