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做BSA混池定位时，亲本不纯，还有分离，可以做么？
可以做，但是需要找出做杂交组合时所使用的亲本的性状，比如：父本有分离，做杂交时选取的是绿色叶片的，那么在测序时，父本也要选取绿色的。 当然，结果可能会比较差，这个得看具体的材料、性状以及群体大小等。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：...
回答于 2018-11-02 11:46
WGCNA的样品不少于15个，15个样品考虑重复吗？
15个样本这个是包含了生物学重复，比如5个时间点3个重复。当然，样品数越多，效果越好，15个只是最低要求。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入...
回答于 2018-10-22 19:23
蛋白质组学TMT/Itraq分析中，馏分和上机时长对鉴定的蛋白数量影...
做TMT/Itraq时，同一个平台不同的上机时长和馏分对鉴定的蛋白数量有影响。 但是不同的平台要达到相同的效果的话，馏分和机时是不一样的。 比如：Orbitrap Fusion Lumos平台做7个馏分，每个馏分1个小时就能达到QEplus 18个馏分各1小时的效果。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析...
回答于 2018-10-19 09:44
同一个物种不同基因组做共线性分析的意义
共线性分析可以分析不同版本基因组间的共线性区域和非共线性区域，找出重组区域，也可以矫正不同基因组在组装过程中出现的错误！ 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看...
回答于 2018-10-12 12:18
BSA混池定位
如果有条件的话最好是单株提取DNA，然后等量混合。但是公司提取的话如没有特殊要求，则是混合后提取。不过如果非得让公司单株提取再等量混合的话，相应的提取费用是要客户承担的。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族...
回答于 2018-09-28 13:50
PacBio ISO-Seq可以做转录本定量吗？
PacBio ISO-Seq 对每个样本通过构建多个不同片段长度的文库，对每个片段的文库也测了不同的深度，最终每个文库进行合并分析，因此就比较困难像二代测序一样对数据进行均一化来评估表达水平的RPKM/FPKM
回答于 2018-09-21 16:08
相同材料不同处理之间，可相同材料不同处理之间，可以放在一起做...
可以将不同处理的样本，合并在一起做分析。WGCNA的方法关注的是调控关系，所以不管是多少个处理组，都可以很好的整合在一起做分析。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看...
回答于 2018-09-13 11:37
做Itraq或TMT蛋白定量分析,植物叶片需要最少多少组织样品?
一般来说单次提取需要200mg左右的组织样品，但是不同的物种其蛋白含量不同，也有十几毫克就能提出足够的蛋白的。所以，在可能的情况下，多的准备组织样品，如果样品实在太少的话，可以准备一份试提的样品，试提一下看看效果。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速...
回答于 2018-09-06 13:05
有参转录组测序分析，各个样品的数据与参考基因组的比对效率多高...
与参考基因组的比对效率与多个因素有关，包括基因组组装质量、测序质量、有无污染等；一般来说，与参考基因组的比对效率在70%以上时，该基因组可以满足后续的分析需求。当比对效率低于60%时，需要考虑换参考基因组或者按照无参转录组分析策略进行分析。 但是，比较特殊的情况得特殊情况特殊处理。分析得灵活。 更多生物信...
回答于 2018-09-04 12:54
做BSA混池定位时，如果分离群体中隐性基因致死，没有纯合隐性植...
没有隐性植株是无法做BSA混池定位的 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）...
回答于 2018-08-23 08:33