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4106 个回答

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老师,请教一下,用gatk call g.vcf.gz格式的文件是,运行中断了...

哪个样本的gvcf中断了,就从那个样本开始跑

回答于 2023-10-30 15:22

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报错pi_manhattan_plot.r command not found…

看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971  加下可执行权限,那些脚本cd $scriptdir && chmod a+x *

回答于 2023-10-30 13:40

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gvcf合并成vcf文件

只能和前10的gvcf合并

回答于 2023-10-30 13:37

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我做群体结构研究

看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971

回答于 2023-10-30 11:51

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使用xpclr_smooth_line_plot.r绘制时,没有报错,但没有图片生成

看看 $FAI 文件里面的 染色体ID和你的 all.chr.xpclr 染色体ID是否一致; 还有就是 19226500 这个值表示小于这个长度的染色体会被过滤掉;

回答于 2023-10-26 12:28

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关于使用nohup vcftools过滤vcf文件的问题

nohup vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INFO-all \    --stdout --maf 0.05 --max-missing 0.9 --minDP 2 --maxDP 1000 \    --minQ 30 --minGQ 0 --min-alleles 2 --max-alleles 2 \    --remove-indels 2>vcftools.log| gzip - >myresult/nohup1.vcf.gz & 试试上面的这个命令,并且看看这...

回答于 2023-10-23 16:57

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PASA预测基因数目过少

真菌的基因特点大多为单外显子,你需要设置参数避免过滤掉太多信息;

回答于 2023-10-23 11:20

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想做GWAS练习,但进入不了助学大讲堂的镜像

你看看docker的基础用法, 你这个报错可以看看英文提示,说你后台已经有了一个gwas名字的容器,不能再启动相同的容器; 你可以 docker ps 看一下后台的容器,同时这里也有关于docker 的常用命令说明,可以看一下

回答于 2023-10-23 11:09

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专家你好 ,最近手头有一份全基因重测序数据,本人骨科专硕难以...

这个解读起来涉及很多基础知识,你花钱在那个公司做个项目,他们应该用售后服务帮你解读的;不行再来找我们

回答于 2023-10-23 11:03

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mysql database里找不到文件

用不了 mysql 该用sqlite数据库吧;

回答于 2023-10-21 10:09