刚刚试了下是有的,注意自己用的镜像版本 请更新镜像到v2.0 才有:https://www.omicsclass.com/article/2286
回答于 2023-11-03 10:20
对的下载水稻的参考基因组,自己构建ANNOVAR的注释库才行,可以看看这个课程有视频课程:https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ
回答于 2023-11-02 23:12
那是你的 生成bam文件的命令行写错了,才出现这个问题,你没有贴命令行,我也不知道你怎么写错了;
回答于 2023-11-02 23:11
这个你可以看看这个扩增子分析课程里面有进化树分析才行:https://bdtcd.xet.tech/s/qZRiF
回答于 2023-11-02 23:09
你这个不要用记事本编辑文件,可能由于windows和linux文件编码不兼容带来不必要的报错,建议用专业的文本编辑器编辑文件: https://www.omicsclass.com/article/395 并且统一编码 UTF-8
回答于 2023-11-02 09:58
这些命令不要忘记运行设置一下,课程里面都有讲解,请认真看看视频 /work/my_gwas/ 文件夹下有scripts这个文件夹吗?设置变量的时候还需要检查一下,这些文件夹路径是否正确
回答于 2023-11-02 09:17
用新版的镜像v2.0吗? 新版的镜像要重新下载配套的脚本:https://www.omicsclass.com/article/2286
回答于 2023-11-02 09:15
有些命令你别漏掉了,$species 这个变量你么有设置运行 耐心看看视频吧, 或者补补linux基础:https://bdtcd.xet.tech/s/17gwqZ
回答于 2023-11-01 18:11