omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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进行bam文件排序时报错

显示killed，任务杀死了，数据量大电脑内存不够导致系统自动杀死任务，需要提高docker容器内存，看看这个：https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-12-27 16:31

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看格式应该可以运行的，你试试看看的，如果有报错，你可以贴一下报错信息，自己手动解决一下；

回答于 2023-12-27 09:11

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输入的文件有问题吧，报错日志可以贴一下看看

回答于 2023-12-26 14:33

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没看到报错，看样子是中断了；你重新运行看看的，建议后台运行，保留日志文件好查错；在命令前加 nohup 结尾加& 符号后台运行

回答于 2023-12-26 11:25

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没到染色体不建议分析CNV，修改一下这个：-lenFilter 可以改小一些，保留更多的scaffold

回答于 2023-12-26 11:22

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circos出来的图有个svg文件，你输入到adobe illustrator 里面手动修改一下

回答于 2023-12-26 11:19

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有平滑的参数：设置这几个参数：Plot_OnePop.pl

回答于 2023-12-25 20:07

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序列有问题吧，你检查检查的；

回答于 2023-12-24 19:25

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你下载的是原始测序数据，需要做转录组得到基因表达量才行：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2023-12-24 19:23

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多行命令建议写到，一个SH文件里面，运行 reseq.sif sh w.sh

回答于 2023-12-22 21:12