omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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如何根据注释文件信息，提取并计算基因组相应区域（如CDS，exon... 已采纳

基因组注释信息GFF文件里面这些信息都有的，自己提取出来就行，如果需要批量提取建议写perl或者python脚本：可学习： perl入门到精通、perl语言高级、

回答于 2019-07-24 17:56

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目前没有这样的课程，可参考文献：https://www.omicsclass.com/article/331

回答于 2019-07-24 09:57

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SMART用法错了吧，参考这里：https://www.omicsclass.com/article/681

回答于 2019-07-23 17:37

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AI绘图就是手动绘图，你这个得自己学习AI就会绘制了；

回答于 2019-07-23 17:35

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可能有的转录本没有基因ID，所以这个脚本报错了，你可以在gff里面搜索对应的mRna行把他删除再运行脚本。

回答于 2019-07-23 10:04

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如果全长序列差异太大建议用结构域序列构建进化树，检查很短的6条序列是否具有完整结构域，酌情删除。

回答于 2019-07-23 10:02

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新手不建议自己改文件格式，自己下载课程中对应的文件，再找找看吧；基因组发布了，这些文件肯定有的；

回答于 2019-07-22 18:05

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基因不多的话，可以用 adobe illustrator 手动绘制

回答于 2019-07-22 18:03

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高版本的hmmsearch 会报这个错误，建议删除这个参数--cut_tc hmmer 3.1b2 不会报错，

回答于 2019-07-22 10:45

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出现什么问题？问题描述清楚

回答于 2019-07-22 10:31