omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

初学者不建议用eclipse中的statET插件编写R脚本语言，建议使用Rstudio编写测试R代码会更好。

回答于 2019-07-29 13:52

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有些序列差异太大，建议删除些gap再构建进化树，或者直接用基因的结构域序列构建进化树；

回答于 2019-07-29 13:50

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找到对应区间里面的基因，然后blast同源比对nr或者nt库注释看看基因功能。

回答于 2019-07-29 12:42

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建议读读其他物种中分析这个家族的参考文献，看看别人怎么命名你这个家族；

回答于 2019-07-29 10:25

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引号去掉试试：详细java环境配置：https://www.omicsclass.com/article/298

回答于 2019-07-29 10:15

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你具体看看结构域序列是否是你要的结构域，是的话建议保留；

回答于 2019-07-29 10:12

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要先输入序列才行，退到主界面选1，输入序列文件路径；

回答于 2019-07-29 10:11

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进化树太慢，建议用NJ方法构建会快一些，ML法最慢；

回答于 2019-07-29 10:08

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文件里面的基因ID位置对应的染色体要一致，你的命令没有截全，有文件路径写错了，你检查一下；

回答于 2019-07-29 10:07

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看不到你的文件，只能推测你进化树文件，gff文件，还有motiff文件里面的基因ID的统一。还有格式要正确才行；先试试单独或者两两组合绘制能否成功，追一排除文件格式错误

回答于 2019-07-27 15:59