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普通烟草Nicotiana tabacum 有基因组吗,组装到染色体了吗

烟草基因组上传到了茄科物种的基因组数据库网站:https://solgenomics.net/ 普通烟草基因组:https://solgenomics.net/organism/Nicotiana_tabacum/genome  基因组数据有两个版本分别是(点击链接可下载基因组信息):Edwards 2017 和 Sierro 2014 参考文献: Edwards, K. et al. A reference genome for Nicotiana taba...

回答于 2019-06-18 16:24

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在eclipse中安装statET时出现问题

R语言建议使用Rstudio 编辑;初学者不建议用eclipse;

回答于 2019-06-18 09:35

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老师,请问您一个ncbi上传序列的问题,16SrDNA和16rRNA的ncbi上...

不好意思这个单独上传一条序列没有上传过,你可以再看看NCBI的说明;

回答于 2019-06-13 14:43

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问下在做基因家族进化树时,建的树bootstrap好多为0,这对发文章...

树枝不可靠,你检查序列之间的差异是不是有些大?

回答于 2019-06-08 12:43

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如何下载NCBI中SAR数据库中的数据?

从NCBI的SRA数据库当中下载高通量测序数据有很多方法,这里简单的方法可以用迅雷下载:https://www.omicsclass.com/article/53

回答于 2019-06-08 12:41

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老师,有没有一个课程,讲述的是热图中FPKM中的来源,,以及如何...

FPKM 的计算原理可以学习:有参转录组结果解读 如果想自己从原始测序文件比对获取fpkm需要自行分析转录组:转录组自主分析

回答于 2019-06-08 12:40

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老师,你好,就是那个bio-Linux的虚拟机我用完关机了,下次重新...

共享目录不能自动挂载,每次关键重启之后需要把共享目录的挂载命令重新运行一下就好; 共享目录的设置方法:https://www.omicsclass.com/article/260 

回答于 2019-06-08 12:29

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生成MCScanX的gff文件时发现蛋白序列id是cds序列的id,请问怎么...

看看你的cds序列中的ID是否在gff中能搜索到?如果能搜索到,你需要编写脚本把对应的ID关系批量的提取出来; 建议学习perl语言可以完成: perl入门到精通、perl语言高级 如果自己没有编程基础,无法处理,建议不要在NCBI上下载参考基因组,其他enseml 或者JGI等数据库下载参考基因组;

回答于 2019-06-06 10:57

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老师您好,circos图的配置文件能否给我发一下感谢!

这里有配置文件你看一下:https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2019-06-05 09:04

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老师好!做比较基因组分析时/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/...

可以将输入文件都截图一下,才好分析文件是哪里出错了; 或者,这个错误可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/572

回答于 2019-06-04 10:56