10 怎么使用命令进行对各序列文件的clustalw比对?

attachments-2019-08-G2WgYDZk5d4e2878385f9.jpg都是这样分属于不同文件,一个一个比对比较麻烦,请问用什么命令可以clustalw批量比对?希望老师指点一下。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

以下是批量比对示例命令,\n代表回车,你可以批量产生这些命令写到一个sh文件里面,然后批量运行:


echo "1\nWRKY_domain.fa\n2\n1\nWRKY_domain.aln\nWRKY_domain.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw
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  • 李剑Bingo 提出于 2019-08-10 10:15

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