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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4095 个回答

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参考基因组比对,sam为空

索引的路径把文件后缀删掉:

回答于 2020-09-30 10:14

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请问做基因组内共线性分析时,下图中的“genome.blocklink.txt”文...

课程里面有详细讲解,你观看课程吧: https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 

回答于 2020-09-29 10:03

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请问做基因组内共线性分析时,发现只有 一对 串联重复基因,这个...

有些少,但是也可以展示一下。

回答于 2020-09-29 10:02

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请问老师基因串联重复出现这种错误该如何配置文件?

配置文件写错了吧,你检查一下

回答于 2020-09-29 10:01

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请问老师如何利用blast做基因串联重复?

基因家族分析课程里有相关课程你可以学习一下: https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 

回答于 2020-09-29 10:01

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各位老师 计算KaKs时 加上空缺的- 总长度是2215 不是3的倍数 那...

cds比对可以先蛋白比对,再转换成cds比对,就不会出现这种情况了:参考这里:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2020-09-28 18:05

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mega构建进化树如何选择模型

理论上应该尝试各种模型,根据检验结果选择最合适的模型进行计算。但在实际操作中,可先尝试选用较简单的距离模型,比如 p-distance。第三个参数是 Gap/Missing Data Treatment。大多数建树方法会要求删除多序列比对中含有空位的列。但是根据遗传距离度量方法的不同,删除原则也不同。如果是以序列间不同残基的个数来度量遗...

回答于 2020-09-28 17:14

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请问有没有有关一个“科”物种转录组的汇总研究

目前我没有发现,你自己可以搜索文献查找一下

回答于 2020-09-28 13:00

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编号以TC开头的基因能在什么数据库里查到序列

你再哪里得到的ID,去查一下就好了; 

回答于 2020-09-28 12:59

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GO富集分析

转录组课程里面有对应的脚本你可以去看看: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM  

回答于 2020-09-28 12:59