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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4109 个回答

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老师您好,我这边在进行扩增子数据处理时,进行到生成OTU_table...

换个电脑试试,你这还是以前的

回答于 2022-01-15 15:52

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老师好!安捷伦的双通道芯片在标准化后是否可以通过limma包eBaye...

双通道的数据,可以直接比较差异;

回答于 2022-01-15 15:51

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老师你好,我换了一台32g的电脑,并且启动时给分配了16g的内存,...

你没换电脑吧,我记得这图还是原来的图

回答于 2022-01-15 15:50

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LDdecay

可以用bin的文件绘制,线会平滑些; 做LD分析,不要过滤LD,多保留些SNP 

回答于 2022-01-14 11:32

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各位老师好,jcvi使用时报错如下,请问应该如何解决呢?非常感谢...

都是 top  可能有问题吧

回答于 2022-01-14 11:30

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老师,您好,我在学linux系统的使用第二讲想下载镜像,但是出错...

你的docker没有安装成功,再看看课程吧:https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0

回答于 2022-01-13 09:13

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基于SNP绘制的进化树怎么添加外类群?

外群也测序一下,放在一起构建进化树

回答于 2022-01-13 09:12

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老师您好,我这边在处理扩增子数据分析时,进行OTU分析时不论用...

可以看看这个问题: https://www.omicsclass.com/question/3975  怀疑是内存不够,你找个内存高的电脑试试的,至少20G以上的吧;   或者把这两个文件的内容贴一下我看看:

回答于 2022-01-11 16:43

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Tajima's D 计算结果出图空白。

你的vcf数据有问题,窗口里面都没有SNP:

回答于 2022-01-11 09:29

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#fst 与 pi 联合 筛选受选择区域

fst和Pi滑窗用的窗口和步长要统一,不然脚本无法合并相同的窗口进行汇总绘图:

回答于 2022-01-10 14:34