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您好，alpha和beta多样性分析sampling-depth 16900如何确定？
一般设置成tag数最少的那个样本对应的数值； 视频课程里面由说明的，你可能没有仔细看吧， 如果真的跳了3分钟，你可以截图看看
回答于 2021-12-23 09:31
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扩增子测序分析，qiime1的assign_taxonomy.py命令中，如果用blas...
首先 这个脚本是物种分类，这里的相似性是序列与库中的序列的相似性； 我们通常说的聚类相似性97%得到OTU，那是序列聚类，你需要分清楚。 我怀疑你是不是搞错了
回答于 2021-12-23 09:29
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mutmap方法为什么必须要有回交过程？
回交是避免搭便车效应，避免假阳性。你不能保证你这个突变株 与野生型只有关注的位点不一样，其他地方完全一样。 在M7代1000个品系中，筛选获得30个茎色为紫色的突变体，难道不可以不经过回交，直接将这30个品系分别提取DNA，然后再等量混合进行二代全基因组重测序，从而扣 snp，以定位到基因么？ 你这个方法就不是mutmap...
回答于 2021-12-22 11:31
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你好，请问一下，我返回来的数据是公司将双端测序的结果进行拼接...
单独的read 可以参考这里导入qiime2： https://www.omicsclass.com/question/4244
回答于 2021-12-21 15:27
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